Protein–RNA interactions for Protein: P51693

APLP1, Amyloid-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1P51693 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
APLP1P51693 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APLP1P51693 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APLP1P51693 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APLP1P51693 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APLP1P51693 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
APLP1P51693 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
APLP1P51693 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
APLP1P51693 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APLP1P51693 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APLP1P51693 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APLP1P51693 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APLP1P51693 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APLP1P51693 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APLP1P51693 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
APLP1P51693 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
APLP1P51693 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APLP1P51693 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APLP1P51693 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APLP1P51693 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APLP1P51693 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
APLP1P51693 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APLP1P51693 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
APLP1P51693 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APLP1P51693 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APLP1P51693 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APLP1P51693 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APLP1P51693 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APLP1P51693 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APLP1P51693 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APLP1P51693 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APLP1P51693 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
APLP1P51693 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APLP1P51693 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APLP1P51693 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APLP1P51693 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
APLP1P51693 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APLP1P51693 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APLP1P51693 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APLP1P51693 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APLP1P51693 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APLP1P51693 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APLP1P51693 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APLP1P51693 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APLP1P51693 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APLP1P51693 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APLP1P51693 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
APLP1P51693 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APLP1P51693 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APLP1P51693 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APLP1P51693 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
APLP1P51693 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APLP1P51693 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APLP1P51693 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APLP1P51693 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APLP1P51693 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
APLP1P51693 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APLP1P51693 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APLP1P51693 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APLP1P51693 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APLP1P51693 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APLP1P51693 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APLP1P51693 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APLP1P51693 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APLP1P51693 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APLP1P51693 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APLP1P51693 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms