RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.92■■■■■ 5.58
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.64■■■■■ 4.74
TTC9B-201ENST00000311308 ABCC9O60706 1549 aa44.39■■■■■ 4.7
TTC9B-201ENST00000311308 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.42■■■■■ 4.38
TTC9B-201ENST00000311308 NACADO15069 1562 aa42.21■■■■■ 4.35
TTC9B-201ENST00000311308 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.13■■■■■ 4.33
TTC9B-201ENST00000311308 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.73■■■■■ 4.27
TTC9B-201ENST00000311308 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
TTC9B-201ENST00000311308 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.4■■■■■ 4.22
TTC9B-201ENST00000311308 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.3■■■■■ 4.2
TTC9B-201ENST00000311308 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.28■■■■■ 4.2
TTC9B-201ENST00000311308 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.24■■■■■ 4.19
TTC9B-201ENST00000311308 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.04■■■■■ 4.16
TTC9B-201ENST00000311308 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.7■■■■■ 4.11
TTC9B-201ENST00000311308 SCRIBQ14160 1630 aa40.69■■■■■ 4.1
TTC9B-201ENST00000311308 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
TTC9B-201ENST00000311308 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.08■■■■■ 4.01
TTC9B-201ENST00000311308 CECR2Q9BXF3 1484 aa40■■■■□ 3.99
TTC9B-201ENST00000311308 NCAPD3P42695 1498 aa38.96■■■■□ 3.83
TTC9B-201ENST00000311308 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.86■■■■□ 3.81
TTC9B-201ENST00000311308 SMARCA4P51532 1647 aa38.85■■■■□ 3.81
TTC9B-201ENST00000311308 SMARCA2P51531 1590 aa38.81■■■■□ 3.8
TTC9B-201ENST00000311308 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
TTC9B-201ENST00000311308 HMGXB3Q12766 1538 aa38.68■■■■□ 3.78
TTC9B-201ENST00000311308 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
TTC9B-201ENST00000311308 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.48■■■■□ 3.75
TTC9B-201ENST00000311308 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.43■■■■□ 3.74
TTC9B-201ENST00000311308 ERCC6Q03468 1493 aa38.41■■■■□ 3.74
TTC9B-201ENST00000311308 CUX2O14529 1486 aa38.21■■■■□ 3.71
TTC9B-201ENST00000311308 NESP48681 1621 aa38.16■■■■□ 3.7
TTC9B-201ENST00000311308 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.02■■■■□ 3.68
TTC9B-201ENST00000311308 WIZO95785 1651 aa37.95■■■■□ 3.66
TTC9B-201ENST00000311308 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.88■■■■□ 3.66
TTC9B-201ENST00000311308 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.83■■■■□ 3.65
TTC9B-201ENST00000311308 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.82■■■■□ 3.65
TTC9B-201ENST00000311308 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
TTC9B-201ENST00000311308 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
TTC9B-201ENST00000311308 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.63■■■■□ 3.62
TTC9B-201ENST00000311308 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.61
TTC9B-201ENST00000311308 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.46■■■■□ 3.59
TTC9B-201ENST00000311308 CFTRP13569 1480 aa37.41■■■■□ 3.58
TTC9B-201ENST00000311308 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.39■■■■□ 3.58
TTC9B-201ENST00000311308 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.36■■■■□ 3.57
TTC9B-201ENST00000311308 WDR62O43379 1518 aa37.32■■■■□ 3.57
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.13■■■■□ 3.54
TTC9B-201ENST00000311308 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
TTC9B-201ENST00000311308 PRDM2Q13029 1718 aa36.93■■■■□ 3.5
TTC9B-201ENST00000311308 ABCC8Q09428 1581 aa36.7■■■■□ 3.46
TTC9B-201ENST00000311308 TOPBP1Q92547 1522 aa36.66■■■■□ 3.46
TTC9B-201ENST00000311308 IFT140Q96RY7 1462 aa36.65■■■■□ 3.46
TTC9B-201ENST00000311308 OSCARQ8IYS5 282 aa36.56■■■■□ 3.44
TTC9B-201ENST00000311308 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.56■■■■□ 3.44
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
TTC9B-201ENST00000311308 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
TTC9B-201ENST00000311308 TRIM41Q8WV44 630 aa36.32■■■■□ 3.4
TTC9B-201ENST00000311308 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
TTC9B-201ENST00000311308 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
TTC9B-201ENST00000311308 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
TTC9B-201ENST00000311308 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.21■■■■□ 3.39
TTC9B-201ENST00000311308 SOGA1O94964 1423 aa36.19■■■■□ 3.38
TTC9B-201ENST00000311308 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.15■■■■□ 3.38
TTC9B-201ENST00000311308 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.11■■■■□ 3.37
TTC9B-201ENST00000311308 CUX1P39880 1505 aa36.1■■■■□ 3.37
TTC9B-201ENST00000311308 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
TTC9B-201ENST00000311308 FBLN2P98095 1184 aa36.02■■■■□ 3.36
TTC9B-201ENST00000311308 WDR97A6NE52 1622 aa36.01■■■■□ 3.35
TTC9B-201ENST00000311308 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.9■■■■□ 3.34
TTC9B-201ENST00000311308 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.9■■■■□ 3.34
TTC9B-201ENST00000311308 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.9■■■■□ 3.34
TTC9B-201ENST00000311308 CHD1O14646 1710 aa35.89■■■■□ 3.34
TTC9B-201ENST00000311308 ARHGEF11O15085 1522 aa35.87■■■■□ 3.33
TTC9B-201ENST00000311308 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC9B-201ENST00000311308 GRIN2BQ13224 1484 aa35.86■■■■□ 3.33
TTC9B-201ENST00000311308 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
TTC9B-201ENST00000311308 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
TTC9B-201ENST00000311308 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.75■■■■□ 3.31
TTC9B-201ENST00000311308 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.75■■■■□ 3.31
TTC9B-201ENST00000311308 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.72■■■■□ 3.31
TTC9B-201ENST00000311308 SYNJ2O15056 1496 aa35.69■■■■□ 3.3
TTC9B-201ENST00000311308 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.66■■■■□ 3.3
TTC9B-201ENST00000311308 SYNJ1O43426 1573 aa35.64■■■■□ 3.3
TTC9B-201ENST00000311308 TOP2BQ02880 1626 aa35.62■■■■□ 3.29
TTC9B-201ENST00000311308 PBRM1Q86U86 1689 aa35.6■■■■□ 3.29
TTC9B-201ENST00000311308 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.6■■■■□ 3.29
TTC9B-201ENST00000311308 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.58■■■■□ 3.29
TTC9B-201ENST00000311308 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.55■■■■□ 3.28
TTC9B-201ENST00000311308 ARAP1Q96P48 1450 aa35.52■■■■□ 3.28
TTC9B-201ENST00000311308 GRIN2AQ12879 1464 aa35.35■■■■□ 3.25
TTC9B-201ENST00000311308 ADAMTS12P58397 1594 aa35.34■■■■□ 3.25
TTC9B-201ENST00000311308 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.33■■■■□ 3.25
TTC9B-201ENST00000311308 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.32■■■■□ 3.24
TTC9B-201ENST00000311308 NUP160Q12769 1436 aa35.23■■■■□ 3.23
TTC9B-201ENST00000311308 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
TTC9B-201ENST00000311308 CEP170Q5SW79 1584 aa35.15■■■■□ 3.22
TTC9B-201ENST00000311308 KIF27Q86VH2 1401 aa35.04■■■■□ 3.2
TTC9B-201ENST00000311308 SHROOM2Q13796 1616 aa34.96■■■■□ 3.19
TTC9B-201ENST00000311308 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.96■■■■□ 3.19
TTC9B-201ENST00000311308 IGF1RP08069 1367 aa34.93■■■■□ 3.18
TTC9B-201ENST00000311308 JPH4Q96JJ6 628 aa34.93■■■■□ 3.18
TTC9B-201ENST00000311308 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
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