Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2IP78347 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms