Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF2E1P29083 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF2E1P29083 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF2E1P29083 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms