Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN17

LIN28B, Protein lin-28 homolog B, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28BQ6ZN17 GPSM2-203ENST00000435475 992 ntTSL 324.11■■□□□ 1.452e-10■■■■■ 36.2
LIN28BQ6ZN17 GPSM2-206ENST00000446797 571 ntTSL 48.15□□□□□ -1.12e-10■■■■■ 36.2
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LIN28BQ6ZN17 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 36.1
LIN28BQ6ZN17 H3F3B-210ENST00000591890 783 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.452e-21■■■■■ 36.1
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LIN28BQ6ZN17 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 36.1
LIN28BQ6ZN17 UBR3-204ENST00000430321 5411 ntTSL 55.7□□□□□ -1.53e-8■■■■■ 36.1
LIN28BQ6ZN17 UBR3-202ENST00000392632 5129 ntTSL 53.72□□□□□ -1.813e-8■■■■■ 36.1
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LIN28BQ6ZN17 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.291e-12■■■■■ 36
LIN28BQ6ZN17 ADCY9-207ENST00000576936 697 ntTSL 514.94□□□□□ -0.021e-12■■■■■ 36
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LIN28BQ6ZN17 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.33e-11■■■■■ 36
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