RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513020.5

SH3BP2-224, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 868 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-224ENST00000513020 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP2-224ENST00000513020 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-224ENST00000513020 ABCC9O60706 1549 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-224ENST00000513020 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-224ENST00000513020 NACADO15069 1562 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2-224ENST00000513020 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2-224ENST00000513020 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SH3BP2-224ENST00000513020 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-224ENST00000513020 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP2-224ENST00000513020 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-224ENST00000513020 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
SH3BP2-224ENST00000513020 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-224ENST00000513020 SCRIBQ14160 1630 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-224ENST00000513020 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-224ENST00000513020 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-224ENST00000513020 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2-224ENST00000513020 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP2-224ENST00000513020 CECR2Q9BXF3 1484 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-224ENST00000513020 SMARCA4P51532 1647 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-224ENST00000513020 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-224ENST00000513020 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-224ENST00000513020 NCAPD3P42695 1498 aa22.6■■□□□ 1.21
SH3BP2-224ENST00000513020 SMARCA2P51531 1590 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-224ENST00000513020 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-224ENST00000513020 HMGXB3Q12766 1538 aa22.52■■□□□ 1.19
SH3BP2-224ENST00000513020 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-224ENST00000513020 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-224ENST00000513020 WIZO95785 1651 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-224ENST00000513020 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-224ENST00000513020 NESP48681 1621 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-224ENST00000513020 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SH3BP2-224ENST00000513020 ERCC6Q03468 1493 aa22.08■■□□□ 1.12
SH3BP2-224ENST00000513020 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-224ENST00000513020 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-224ENST00000513020 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-224ENST00000513020 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-224ENST00000513020 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-224ENST00000513020 CUX2O14529 1486 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP2-224ENST00000513020 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-224ENST00000513020 CFTRP13569 1480 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-224ENST00000513020 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-224ENST00000513020 PRDM2Q13029 1718 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-224ENST00000513020 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-224ENST00000513020 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-224ENST00000513020 WDR62O43379 1518 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-224ENST00000513020 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-224ENST00000513020 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-224ENST00000513020 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-224ENST00000513020 TOPBP1Q92547 1522 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2-224ENST00000513020 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP2-224ENST00000513020 ABCC8Q09428 1581 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-224ENST00000513020 IFT140Q96RY7 1462 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-224ENST00000513020 CUX1P39880 1505 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-224ENST00000513020 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-224ENST00000513020 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-224ENST00000513020 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2-224ENST00000513020 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP2-224ENST00000513020 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.1■□□□□ 0.97
SH3BP2-224ENST00000513020 SOGA1O94964 1423 aa21.06■□□□□ 0.96
SH3BP2-224ENST00000513020 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.03■□□□□ 0.96
SH3BP2-224ENST00000513020 WDR97A6NE52 1622 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP2-224ENST00000513020 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP2-224ENST00000513020 SYNJ1O43426 1573 aa20.99■□□□□ 0.95
SH3BP2-224ENST00000513020 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.95
SH3BP2-224ENST00000513020 TOP2BQ02880 1626 aa20.97■□□□□ 0.95
SH3BP2-224ENST00000513020 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SH3BP2-224ENST00000513020 CHD1O14646 1710 aa20.9■□□□□ 0.94
SH3BP2-224ENST00000513020 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.89■□□□□ 0.94
SH3BP2-224ENST00000513020 OSCARQ8IYS5 282 aa20.89■□□□□ 0.93
SH3BP2-224ENST00000513020 PBRM1Q86U86 1689 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP2-224ENST00000513020 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.86■□□□□ 0.93
SH3BP2-224ENST00000513020 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP2-224ENST00000513020 GRIN2BQ13224 1484 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-224ENST00000513020 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP2-224ENST00000513020 FBLN2P98095 1184 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-224ENST00000513020 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
SH3BP2-224ENST00000513020 SYNJ2O15056 1496 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP2-224ENST00000513020 TRIM41Q8WV44 630 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP2-224ENST00000513020 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
SH3BP2-224ENST00000513020 ADAMTS12P58397 1594 aa20.67■□□□□ 0.9
SH3BP2-224ENST00000513020 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-224ENST00000513020 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-224ENST00000513020 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP2-224ENST00000513020 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BP2-224ENST00000513020 ARHGEF11O15085 1522 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 GRIN2AQ12879 1464 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-224ENST00000513020 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 KIF27Q86VH2 1401 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 CEP170Q5SW79 1584 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 NUP160Q12769 1436 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 CUL7Q14999 1698 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 ARAP1Q96P48 1450 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-224ENST00000513020 IGF1RP08069 1367 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP2-224ENST00000513020 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-224ENST00000513020 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-224ENST00000513020 SHROOM2Q13796 1616 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-224ENST00000513020 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-224ENST00000513020 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.34■□□□□ 0.85
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