RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466638.5

PNCK-222, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 2

Gene PNCK, Length 1,204 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-222	ENST00000466638	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PNCK-222	ENST00000466638	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.65	■■■■□ 3.3
PNCK-222	ENST00000466638	ABCC9	O60706	1549 aa		34.91	■■■■□ 3.18
PNCK-222	ENST00000466638	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PNCK-222	ENST00000466638	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PNCK-222	ENST00000466638	NACAD	O15069	1562 aa		33.51	■■■□□ 2.96
PNCK-222	ENST00000466638	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PNCK-222	ENST00000466638	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PNCK-222	ENST00000466638	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PNCK-222	ENST00000466638	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PNCK-222	ENST00000466638	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.61	■■■□□ 2.81	3e-6	■■■■□ 22.6
PNCK-222	ENST00000466638	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PNCK-222	ENST00000466638	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PNCK-222	ENST00000466638	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PNCK-222	ENST00000466638	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PNCK-222	ENST00000466638	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
PNCK-222	ENST00000466638	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PNCK-222	ENST00000466638	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PNCK-222	ENST00000466638	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PNCK-222	ENST00000466638	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
PNCK-222	ENST00000466638	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.95	■■■□□ 2.54
PNCK-222	ENST00000466638	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.92	■■■□□ 2.54
PNCK-222	ENST00000466638	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.91	■■■□□ 2.54
PNCK-222	ENST00000466638	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.91	■■■□□ 2.54
PNCK-222	ENST00000466638	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.79	■■■□□ 2.52
PNCK-222	ENST00000466638	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.78	■■■□□ 2.52
PNCK-222	ENST00000466638	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.71	■■■□□ 2.51
PNCK-222	ENST00000466638	WIZ	O95785	1651 aa		30.59	■■■□□ 2.49
PNCK-222	ENST00000466638	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.54	■■■□□ 2.48
PNCK-222	ENST00000466638	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.25	■■■□□ 2.43
PNCK-222	ENST00000466638	NES	P48681	1621 aa		30.2	■■■□□ 2.43
PNCK-222	ENST00000466638	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.11	■■■□□ 2.41
PNCK-222	ENST00000466638	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.1	■■■□□ 2.41
PNCK-222	ENST00000466638	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.02	■■■□□ 2.4
PNCK-222	ENST00000466638	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.91	■■■□□ 2.38
PNCK-222	ENST00000466638	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.89	■■■□□ 2.38
PNCK-222	ENST00000466638	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PNCK-222	ENST00000466638	CFTR	P13569	1480 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PNCK-222	ENST00000466638	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
PNCK-222	ENST00000466638	CUX2	O14529	1486 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PNCK-222	ENST00000466638	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PNCK-222	ENST00000466638	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PNCK-222	ENST00000466638	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PNCK-222	ENST00000466638	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PNCK-222	ENST00000466638	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.64	■■■□□ 2.34
PNCK-222	ENST00000466638	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.61	■■■□□ 2.33
PNCK-222	ENST00000466638	WDR62	O43379	1518 aa		29.51	■■■□□ 2.32
PNCK-222	ENST00000466638	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.39	■■■□□ 2.3
PNCK-222	ENST00000466638	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PNCK-222	ENST00000466638	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PNCK-222	ENST00000466638	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PNCK-222	ENST00000466638	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PNCK-222	ENST00000466638	CUX1	P39880	1505 aa		29	■■■□□ 2.23
PNCK-222	ENST00000466638	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PNCK-222	ENST00000466638	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PNCK-222	ENST00000466638	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PNCK-222	ENST00000466638	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PNCK-222	ENST00000466638	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PNCK-222	ENST00000466638	SOGA1	O94964	1423 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PNCK-222	ENST00000466638	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PNCK-222	ENST00000466638	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.81	■■■□□ 2.2
PNCK-222	ENST00000466638	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PNCK-222	ENST00000466638	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PNCK-222	ENST00000466638	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PNCK-222	ENST00000466638	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.74	■■■□□ 2.19	4e-8	■■■■■ 27.4
PNCK-222	ENST00000466638	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PNCK-222	ENST00000466638	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PNCK-222	ENST00000466638	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PNCK-222	ENST00000466638	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PNCK-222	ENST00000466638	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PNCK-222	ENST00000466638	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PNCK-222	ENST00000466638	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PNCK-222	ENST00000466638	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PNCK-222	ENST00000466638	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PNCK-222	ENST00000466638	CHD1	O14646	1710 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PNCK-222	ENST00000466638	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
PNCK-222	ENST00000466638	FBLN2	P98095	1184 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PNCK-222	ENST00000466638	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PNCK-222	ENST00000466638	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PNCK-222	ENST00000466638	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PNCK-222	ENST00000466638	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PNCK-222	ENST00000466638	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PNCK-222	ENST00000466638	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.2	■■■□□ 2.11
PNCK-222	ENST00000466638	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PNCK-222	ENST00000466638	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PNCK-222	ENST00000466638	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PNCK-222	ENST00000466638	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PNCK-222	ENST00000466638	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PNCK-222	ENST00000466638	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PNCK-222	ENST00000466638	IGF1R	P08069	1367 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PNCK-222	ENST00000466638	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PNCK-222	ENST00000466638	CUL7	Q14999	1698 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PNCK-222	ENST00000466638	NUP160	Q12769	1436 aa		28.01	■■■□□ 2.08
PNCK-222	ENST00000466638	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PNCK-222	ENST00000466638	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PNCK-222	ENST00000466638	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PNCK-222	ENST00000466638	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PNCK-222	ENST00000466638	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PNCK-222	ENST00000466638	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PNCK-222	ENST00000466638	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		27.78	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms