RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.95	■■■■■ 4.31
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABCC9	O60706	1549 aa		37.98	■■■■□ 3.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		37.61	■■■■□ 3.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.98	■■■■□ 3.35
SH3BP2-223	ENST00000512131	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.94	■■■■□ 3.34
SH3BP2-223	ENST00000512131	NACAD	O15069	1562 aa		35.68	■■■■□ 3.3
SH3BP2-223	ENST00000512131	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.48	■■■■□ 3.27
SH3BP2-223	ENST00000512131	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.35	■■■■□ 3.25
SH3BP2-223	ENST00000512131	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.13	■■■■□ 3.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.08	■■■■□ 3.21
SH3BP2-223	ENST00000512131	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.97	■■■■□ 3.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.97	■■■■□ 3.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.76	■■■■□ 3.15
SH3BP2-223	ENST00000512131	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.49	■■■■□ 3.11
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.3	■■■■□ 3.08
SH3BP2-223	ENST00000512131	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.26	■■■■□ 3.08
SH3BP2-223	ENST00000512131	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.26	■■■■□ 3.07
SH3BP2-223	ENST00000512131	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.14	■■■■□ 3.06
SH3BP2-223	ENST00000512131	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SH3BP2-223	ENST00000512131	NCAPD3	P42695	1498 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SH3BP2-223	ENST00000512131	CUX2	O14529	1486 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SH3BP2-223	ENST00000512131	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMARCA2	P51531	1590 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP2-223	ENST00000512131	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SH3BP2-223	ENST00000512131	NES	P48681	1621 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SH3BP2-223	ENST00000512131	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SH3BP2-223	ENST00000512131	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
SH3BP2-223	ENST00000512131	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SH3BP2-223	ENST00000512131	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SH3BP2-223	ENST00000512131	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SH3BP2-223	ENST00000512131	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.11	■■■□□ 2.73
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.03	■■■□□ 2.72
SH3BP2-223	ENST00000512131	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		31.99	■■■□□ 2.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	WIZ	O95785	1651 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.84	■■■□□ 2.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	WDR62	O43379	1518 aa		31.76	■■■□□ 2.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
SH3BP2-223	ENST00000512131	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SH3BP2-223	ENST00000512131	CFTR	P13569	1480 aa		31.55	■■■□□ 2.64
SH3BP2-223	ENST00000512131	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SH3BP2-223	ENST00000512131	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SH3BP2-223	ENST00000512131	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.03	■■■□□ 2.56
SH3BP2-223	ENST00000512131	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.96	■■■□□ 2.55
SH3BP2-223	ENST00000512131	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.89	■■■□□ 2.54
SH3BP2-223	ENST00000512131	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.89	■■■□□ 2.54
SH3BP2-223	ENST00000512131	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.89	■■■□□ 2.54
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.87	■■■□□ 2.53
SH3BP2-223	ENST00000512131	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.8	■■■□□ 2.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.8	■■■□□ 2.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.79	■■■□□ 2.52
SH3BP2-223	ENST00000512131	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.71	■■■□□ 2.51
SH3BP2-223	ENST00000512131	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.69	■■■□□ 2.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.64	■■■□□ 2.5
SH3BP2-223	ENST00000512131	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.63	■■■□□ 2.49
SH3BP2-223	ENST00000512131	FBLN2	P98095	1184 aa		30.57	■■■□□ 2.48
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHD1	O14646	1710 aa		30.56	■■■□□ 2.48
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.53	■■■□□ 2.48
SH3BP2-223	ENST00000512131	SOGA1	O94964	1423 aa		30.5	■■■□□ 2.47
SH3BP2-223	ENST00000512131	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.5	■■■□□ 2.47
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.5	■■■□□ 2.47
SH3BP2-223	ENST00000512131	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.39	■■■□□ 2.46
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.38	■■■□□ 2.45
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.35	■■■□□ 2.45
SH3BP2-223	ENST00000512131	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.34	■■■□□ 2.45
SH3BP2-223	ENST00000512131	CUX1	P39880	1505 aa		30.32	■■■□□ 2.44
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.31	■■■□□ 2.44
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.29	■■■□□ 2.44
SH3BP2-223	ENST00000512131	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.28	■■■□□ 2.44
SH3BP2-223	ENST00000512131	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.26	■■■□□ 2.44
SH3BP2-223	ENST00000512131	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.22	■■■□□ 2.43
SH3BP2-223	ENST00000512131	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.19	■■■□□ 2.42
SH3BP2-223	ENST00000512131	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.13	■■■□□ 2.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.12	■■■□□ 2.41
SH3BP2-223	ENST00000512131	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.06	■■■□□ 2.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.05	■■■□□ 2.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.05	■■■□□ 2.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.01	■■■□□ 2.4
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SH3BP2-223	ENST00000512131	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SH3BP2-223	ENST00000512131	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SH3BP2-223	ENST00000512131	NUP160	Q12769	1436 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SH3BP2-223	ENST00000512131	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SH3BP2-223	ENST00000512131	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SH3BP2-223	ENST00000512131	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	29.67	■■■□□ 2.34
SH3BP2-223	ENST00000512131	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SH3BP2-223	ENST00000512131	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.64	■■■□□ 2.34
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.53	■■■□□ 2.32
SH3BP2-223	ENST00000512131	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.51	■■■□□ 2.31
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.5	■■■□□ 2.31

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