RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.81■■■■□ 3.16
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SH3BP2-205ENST00000502260 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.16■■■□□ 2.58
SH3BP2-205ENST00000502260 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-205ENST00000502260 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BP2-205ENST00000502260 NACADO15069 1562 aa29.6■■■□□ 2.33
SH3BP2-205ENST00000502260 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-205ENST00000502260 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
SH3BP2-205ENST00000502260 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.17■■■□□ 2.26
SH3BP2-205ENST00000502260 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-205ENST00000502260 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-205ENST00000502260 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
SH3BP2-205ENST00000502260 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.73■■■□□ 2.19
SH3BP2-205ENST00000502260 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP2-205ENST00000502260 SCRIBQ14160 1630 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP2-205ENST00000502260 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.39■■■□□ 2.13
SH3BP2-205ENST00000502260 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.36■■■□□ 2.13
SH3BP2-205ENST00000502260 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SH3BP2-205ENST00000502260 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP2-205ENST00000502260 NCAPD3P42695 1498 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP2-205ENST00000502260 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP2-205ENST00000502260 CUX2O14529 1486 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-205ENST00000502260 ERCC6Q03468 1493 aa27.17■■□□□ 1.94
SH3BP2-205ENST00000502260 SMARCA2P51531 1590 aa27.14■■□□□ 1.93
SH3BP2-205ENST00000502260 SMARCA4P51532 1647 aa27.12■■□□□ 1.93
SH3BP2-205ENST00000502260 HMGXB3Q12766 1538 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-205ENST00000502260 NESP48681 1621 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP2-205ENST00000502260 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
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SH3BP2-205ENST00000502260 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-205ENST00000502260 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-205ENST00000502260 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-205ENST00000502260 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SH3BP2-205ENST00000502260 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-205ENST00000502260 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-205ENST00000502260 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-205ENST00000502260 WIZO95785 1651 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-205ENST00000502260 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-205ENST00000502260 WDR62O43379 1518 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-205ENST00000502260 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-205ENST00000502260 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-205ENST00000502260 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-205ENST00000502260 CFTRP13569 1480 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-205ENST00000502260 TRIM41Q8WV44 630 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-205ENST00000502260 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-205ENST00000502260 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-205ENST00000502260 OSCARQ8IYS5 282 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-205ENST00000502260 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-205ENST00000502260 IFT140Q96RY7 1462 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-205ENST00000502260 TOPBP1Q92547 1522 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP2-205ENST00000502260 PRDM2Q13029 1718 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP2-205ENST00000502260 ABCC8Q09428 1581 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-205ENST00000502260 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-205ENST00000502260 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-205ENST00000502260 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-205ENST00000502260 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-205ENST00000502260 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-205ENST00000502260 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-205ENST00000502260 ARHGEF11O15085 1522 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-205ENST00000502260 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-205ENST00000502260 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-205ENST00000502260 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-205ENST00000502260 FBLN2P98095 1184 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-205ENST00000502260 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-205ENST00000502260 SOGA1O94964 1423 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-205ENST00000502260 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2-205ENST00000502260 ARAP1Q96P48 1450 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-205ENST00000502260 CHD1O14646 1710 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-205ENST00000502260 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2-205ENST00000502260 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-205ENST00000502260 CUX1P39880 1505 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-205ENST00000502260 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-205ENST00000502260 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-205ENST00000502260 WDR97A6NE52 1622 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP2-205ENST00000502260 GRIN2BQ13224 1484 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP2-205ENST00000502260 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-205ENST00000502260 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-205ENST00000502260 SYNJ2O15056 1496 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-205ENST00000502260 SYNJ1O43426 1573 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-205ENST00000502260 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2-205ENST00000502260 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2-205ENST00000502260 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-205ENST00000502260 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-205ENST00000502260 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-205ENST00000502260 PBRM1Q86U86 1689 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-205ENST00000502260 GRIN2AQ12879 1464 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-205ENST00000502260 NUP160Q12769 1436 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-205ENST00000502260 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-205ENST00000502260 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-205ENST00000502260 TOP2BQ02880 1626 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-205ENST00000502260 ADAMTS12P58397 1594 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-205ENST00000502260 CEP170Q5SW79 1584 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-205ENST00000502260 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-205ENST00000502260 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-205ENST00000502260 SHROOM2Q13796 1616 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-205ENST00000502260 JPH4Q96JJ6 628 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-205ENST00000502260 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-205ENST00000502260 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-205ENST00000502260 IGF1RP08069 1367 aa24.37■■□□□ 1.49
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