RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490238.5

IMMT-211, Transcript of inner membrane mitochondrial protein, humanhuman

TSL 4

Gene IMMT, Length 699 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMMT-211ENST00000490238 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.5■□□□□ 0.07
IMMT-211ENST00000490238 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa13.71□□□□□ -0.22
IMMT-211ENST00000490238 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
IMMT-211ENST00000490238 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.99□□□□□ -0.33
IMMT-211ENST00000490238 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.8□□□□□ -0.36
IMMT-211ENST00000490238 NACADO15069 1562 aa12.58□□□□□ -0.4
IMMT-211ENST00000490238 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.41□□□□□ -0.42
IMMT-211ENST00000490238 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.4□□□□□ -0.42
IMMT-211ENST00000490238 ABCC9O60706 1549 aa12.37□□□□□ -0.43
IMMT-211ENST00000490238 SCRIBQ14160 1630 aa12.33□□□□□ -0.43
IMMT-211ENST00000490238 UNC13AQ9UPW8 1703 aa12.29□□□□□ -0.44
IMMT-211ENST00000490238 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.29□□□□□ -0.44
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IMMT-211ENST00000490238 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
IMMT-211ENST00000490238 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
IMMT-211ENST00000490238 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.98□□□□□ -0.49
IMMT-211ENST00000490238 SMARCA4P51532 1647 aa11.95□□□□□ -0.5
IMMT-211ENST00000490238 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.91□□□□□ -0.5
IMMT-211ENST00000490238 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.88□□□□□ -0.51
IMMT-211ENST00000490238 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.88□□□□□ -0.51
IMMT-211ENST00000490238 WIZO95785 1651 aa11.87□□□□□ -0.51
IMMT-211ENST00000490238 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
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IMMT-211ENST00000490238 SMARCA2P51531 1590 aa11.72□□□□□ -0.53
IMMT-211ENST00000490238 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.69□□□□□ -0.54
IMMT-211ENST00000490238 HMGXB3Q12766 1538 aa11.64□□□□□ -0.55
IMMT-211ENST00000490238 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.59□□□□□ -0.55
IMMT-211ENST00000490238 PRDM2Q13029 1718 aa11.59□□□□□ -0.55
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IMMT-211ENST00000490238 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
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IMMT-211ENST00000490238 NCAPD3P42695 1498 aa11.51□□□□□ -0.57
IMMT-211ENST00000490238 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.39□□□□□ -0.59
IMMT-211ENST00000490238 ABCC8Q09428 1581 aa11.37□□□□□ -0.59
IMMT-211ENST00000490238 TRIM41Q8WV44 630 aa11.37□□□□□ -0.59
IMMT-211ENST00000490238 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.37□□□□□ -0.59
IMMT-211ENST00000490238 EEA1Q15075 1411 aa11.36□□□□□ -0.59
IMMT-211ENST00000490238 TOP2BQ02880 1626 aa11.34□□□□□ -0.59
IMMT-211ENST00000490238 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
IMMT-211ENST00000490238 SYNJ1O43426 1573 aa11.31□□□□□ -0.6
IMMT-211ENST00000490238 CFTRP13569 1480 aa11.3□□□□□ -0.6
IMMT-211ENST00000490238 KIF21BO75037 1637 aa11.26□□□□□ -0.61
IMMT-211ENST00000490238 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.2□□□□□ -0.62
IMMT-211ENST00000490238 CUX1P39880 1505 aa11.15□□□□□ -0.62
IMMT-211ENST00000490238 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.15□□□□□ -0.63
IMMT-211ENST00000490238 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.14□□□□□ -0.63
IMMT-211ENST00000490238 GOLGA3Q08378 1498 aa11.14□□□□□ -0.63
IMMT-211ENST00000490238 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.14□□□□□ -0.63
IMMT-211ENST00000490238 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.11□□□□□ -0.63
IMMT-211ENST00000490238 SOGA1O94964 1423 aa11.1□□□□□ -0.63
IMMT-211ENST00000490238 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.09□□□□□ -0.63
IMMT-211ENST00000490238 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.08□□□□□ -0.64
IMMT-211ENST00000490238 WDR97A6NE52 1622 aa11.08□□□□□ -0.64
IMMT-211ENST00000490238 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.05□□□□□ -0.64
IMMT-211ENST00000490238 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.04□□□□□ -0.64
IMMT-211ENST00000490238 CSRNP3Q8WYN3 585 aa11.03□□□□□ -0.64
IMMT-211ENST00000490238 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.03□□□□□ -0.64
IMMT-211ENST00000490238 CUL7Q14999 1698 aa11.01□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 CEP162Q5TB80 1403 aa11.01□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 KIF27Q86VH2 1401 aa11.01□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 PRXQ9BXM0 1461 aa11.01□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.99□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 TOPBP1Q92547 1522 aa10.98□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.97□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.96□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.96□□□□□ -0.65
IMMT-211ENST00000490238 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.95□□□□□ -0.66
IMMT-211ENST00000490238 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa10.94□□□□□ -0.66
IMMT-211ENST00000490238 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
IMMT-211ENST00000490238 NESP48681 1621 aa10.92□□□□□ -0.66
IMMT-211ENST00000490238 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
IMMT-211ENST00000490238 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
IMMT-211ENST00000490238 CUX2O14529 1486 aa10.9□□□□□ -0.66
IMMT-211ENST00000490238 PBRM1Q86U86 1689 aa10.89□□□□□ -0.67
IMMT-211ENST00000490238 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
IMMT-211ENST00000490238 CLIP1P30622 1438 aa10.88□□□□□ -0.67
IMMT-211ENST00000490238 VPS8Q8N3P4 1428 aa10.87□□□□□ -0.67
IMMT-211ENST00000490238 WDR62O43379 1518 aa10.85□□□□□ -0.67
IMMT-211ENST00000490238 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.85□□□□□ -0.67
IMMT-211ENST00000490238 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.84□□□□□ -0.67
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IMMT-211ENST00000490238 IGF1RP08069 1367 aa10.81□□□□□ -0.68
IMMT-211ENST00000490238 PCGF6Q9BYE7 350 aa10.81□□□□□ -0.68
IMMT-211ENST00000490238 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
IMMT-211ENST00000490238 ARAP1Q96P48 1450 aa10.8□□□□□ -0.68
IMMT-211ENST00000490238 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.79□□□□□ -0.68
IMMT-211ENST00000490238 MAP3K1Q13233 1512 aa10.79□□□□□ -0.68
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IMMT-211ENST00000490238 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.77□□□□□ -0.69
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IMMT-211ENST00000490238 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.76□□□□□ -0.69
IMMT-211ENST00000490238 HRCP23327 699 aa10.76□□□□□ -0.69
IMMT-211ENST00000490238 SAMD9Q5K651 1589 aa10.76□□□□□ -0.69
IMMT-211ENST00000490238 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.75□□□□□ -0.69
IMMT-211ENST00000490238 IFT140Q96RY7 1462 aa10.74□□□□□ -0.69
IMMT-211ENST00000490238 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.692e-11■■■■■ 28.5
IMMT-211ENST00000490238 EHMT2Q96KQ7 1210 aa10.71□□□□□ -0.69
IMMT-211ENST00000490238 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
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