RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.73■■■■□ 3.15
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.82■■■□□ 2.52
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCC9O60706 1549 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-208ENST00000504294 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-208ENST00000504294 NACADO15069 1562 aa29.01■■■□□ 2.24
SH3BP2-208ENST00000504294 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-208ENST00000504294 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-208ENST00000504294 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-208ENST00000504294 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.07■■■□□ 2.08
SH3BP2-208ENST00000504294 SCRIBQ14160 1630 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BP2-208ENST00000504294 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28■■■□□ 2.07
SH3BP2-208ENST00000504294 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP2-208ENST00000504294 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.92■■■□□ 2.06
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.24■■□□□ 1.95
SH3BP2-208ENST00000504294 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-208ENST00000504294 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SH3BP2-208ENST00000504294 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-208ENST00000504294 SMARCA4P51532 1647 aa26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-208ENST00000504294 SMARCA2P51531 1590 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BP2-208ENST00000504294 NCAPD3P42695 1498 aa26.75■■□□□ 1.87
SH3BP2-208ENST00000504294 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-208ENST00000504294 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-208ENST00000504294 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BP2-208ENST00000504294 HMGXB3Q12766 1538 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BP2-208ENST00000504294 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-208ENST00000504294 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-208ENST00000504294 WIZO95785 1651 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-208ENST00000504294 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-208ENST00000504294 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-208ENST00000504294 CADPSQ9ULU8 1353 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-208ENST00000504294 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-208ENST00000504294 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-208ENST00000504294 ERCC6Q03468 1493 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.89■■□□□ 1.73
SH3BP2-208ENST00000504294 NESP48681 1621 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-208ENST00000504294 CFTRP13569 1480 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-208ENST00000504294 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP2-208ENST00000504294 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-208ENST00000504294 CUX2O14529 1486 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-208ENST00000504294 PRDM2Q13029 1718 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-208ENST00000504294 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-208ENST00000504294 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCC8Q09428 1581 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR62O43379 1518 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-208ENST00000504294 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2-208ENST00000504294 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-208ENST00000504294 TOPBP1Q92547 1522 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-208ENST00000504294 IFT140Q96RY7 1462 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP2-208ENST00000504294 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-208ENST00000504294 CUX1P39880 1505 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2-208ENST00000504294 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BP2-208ENST00000504294 SOGA1O94964 1423 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP2-208ENST00000504294 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP2-208ENST00000504294 TOP2BQ02880 1626 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-208ENST00000504294 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR97A6NE52 1622 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-208ENST00000504294 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP2-208ENST00000504294 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-208ENST00000504294 SYNJ1O43426 1573 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-208ENST00000504294 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-208ENST00000504294 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-208ENST00000504294 GRIN2BQ13224 1484 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-208ENST00000504294 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM41Q8WV44 630 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-208ENST00000504294 OSCARQ8IYS5 282 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-208ENST00000504294 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF27Q86VH2 1401 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-208ENST00000504294 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-208ENST00000504294 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-208ENST00000504294 FBLN2P98095 1184 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-208ENST00000504294 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-208ENST00000504294 PBRM1Q86U86 1689 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-208ENST00000504294 SYNJ2O15056 1496 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-208ENST00000504294 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.45■■□□□ 1.51
SH3BP2-208ENST00000504294 IGF1RP08069 1367 aa24.39■■□□□ 1.49
SH3BP2-208ENST00000504294 CHD1O14646 1710 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAMTS12P58397 1594 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-208ENST00000504294 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP2-208ENST00000504294 CUL7Q14999 1698 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-208ENST00000504294 GRIN2AQ12879 1464 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-208ENST00000504294 EEA1Q15075 1411 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP2-208ENST00000504294 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP160Q12769 1436 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP2-208ENST00000504294 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-208ENST00000504294 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP2-208ENST00000504294 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-208ENST00000504294 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-208ENST00000504294 CEP170Q5SW79 1584 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGEF11O15085 1522 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-208ENST00000504294 PRXQ9BXM0 1461 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-208ENST00000504294 JPH4Q96JJ6 628 aa24.05■■□□□ 1.44
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