RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-222ENST00000512014 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.54■■■□□ 2.64
SH3BP2-222ENST00000512014 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.11■■■□□ 2.09
SH3BP2-222ENST00000512014 ABCC9O60706 1549 aa27.75■■■□□ 2.03
SH3BP2-222ENST00000512014 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-222ENST00000512014 NACADO15069 1562 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-222ENST00000512014 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-222ENST00000512014 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-222ENST00000512014 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-222ENST00000512014 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-222ENST00000512014 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-222ENST00000512014 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-222ENST00000512014 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-222ENST00000512014 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2-222ENST00000512014 SCRIBQ14160 1630 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-222ENST00000512014 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP2-222ENST00000512014 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SH3BP2-222ENST00000512014 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP2-222ENST00000512014 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-222ENST00000512014 SMARCA4P51532 1647 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-222ENST00000512014 NCAPD3P42695 1498 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2-222ENST00000512014 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.45■■□□□ 1.51
SH3BP2-222ENST00000512014 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-222ENST00000512014 SMARCA2P51531 1590 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-222ENST00000512014 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP2-222ENST00000512014 HMGXB3Q12766 1538 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP2-222ENST00000512014 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-222ENST00000512014 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP2-222ENST00000512014 WIZO95785 1651 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-222ENST00000512014 NESP48681 1621 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-222ENST00000512014 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-222ENST00000512014 ERCC6Q03468 1493 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2-222ENST00000512014 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-222ENST00000512014 CUX2O14529 1486 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-222ENST00000512014 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-222ENST00000512014 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-222ENST00000512014 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-222ENST00000512014 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-222ENST00000512014 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-222ENST00000512014 CFTRP13569 1480 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-222ENST00000512014 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-222ENST00000512014 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-222ENST00000512014 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-222ENST00000512014 WDR62O43379 1518 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-222ENST00000512014 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-222ENST00000512014 PRDM2Q13029 1718 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-222ENST00000512014 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-222ENST00000512014 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-222ENST00000512014 TOPBP1Q92547 1522 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 ABCC8Q09428 1581 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 IFT140Q96RY7 1462 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 CUX1P39880 1505 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-222ENST00000512014 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-222ENST00000512014 SOGA1O94964 1423 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-222ENST00000512014 OSCARQ8IYS5 282 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-222ENST00000512014 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP2-222ENST00000512014 WDR97A6NE52 1622 aa22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-222ENST00000512014 CHD1O14646 1710 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-222ENST00000512014 SYNJ1O43426 1573 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-222ENST00000512014 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-222ENST00000512014 TOP2BQ02880 1626 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-222ENST00000512014 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-222ENST00000512014 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-222ENST00000512014 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-222ENST00000512014 GRIN2BQ13224 1484 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-222ENST00000512014 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-222ENST00000512014 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-222ENST00000512014 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-222ENST00000512014 PBRM1Q86U86 1689 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-222ENST00000512014 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-222ENST00000512014 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-222ENST00000512014 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-222ENST00000512014 FBLN2P98095 1184 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-222ENST00000512014 TRIM41Q8WV44 630 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-222ENST00000512014 ARHGEF11O15085 1522 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-222ENST00000512014 SYNJ2O15056 1496 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-222ENST00000512014 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-222ENST00000512014 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-222ENST00000512014 ADAMTS12P58397 1594 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2-222ENST00000512014 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.24■■□□□ 1.15
SH3BP2-222ENST00000512014 GRIN2AQ12879 1464 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-222ENST00000512014 ARAP1Q96P48 1450 aa22.22■■□□□ 1.15
SH3BP2-222ENST00000512014 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-222ENST00000512014 NUP160Q12769 1436 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-222ENST00000512014 CEP170Q5SW79 1584 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-222ENST00000512014 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-222ENST00000512014 IGF1RP08069 1367 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-222ENST00000512014 KIF27Q86VH2 1401 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-222ENST00000512014 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-222ENST00000512014 SHROOM2Q13796 1616 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-222ENST00000512014 CUL7Q14999 1698 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-222ENST00000512014 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP2-222ENST00000512014 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.88■■□□□ 1.09
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