RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422811.5

PNCK-208, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, humanhuman

TSL 3

Gene PNCK, Length 771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCK-208ENST00000422811 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.04■■■■■ 5.44
PNCK-208ENST00000422811 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.84■■■■■ 4.61
PNCK-208ENST00000422811 ABCC9O60706 1549 aa43.5■■■■■ 4.55
PNCK-208ENST00000422811 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.59■■■■■ 4.25
PNCK-208ENST00000422811 NACADO15069 1562 aa41.38■■■■■ 4.22
PNCK-208ENST00000422811 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.31■■■■■ 4.2
PNCK-208ENST00000422811 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.93■■■■■ 4.14
PNCK-208ENST00000422811 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
PNCK-208ENST00000422811 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.59■■■■■ 4.09
PNCK-208ENST00000422811 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.093e-6■■■■□ 22.6
PNCK-208ENST00000422811 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.54■■■■■ 4.08
PNCK-208ENST00000422811 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.47■■■■■ 4.07
PNCK-208ENST00000422811 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.31■■■■■ 4.04
PNCK-208ENST00000422811 SCRIBQ14160 1630 aa39.97■■■■□ 3.99
PNCK-208ENST00000422811 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.85■■■■□ 3.97
PNCK-208ENST00000422811 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
PNCK-208ENST00000422811 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.3■■■■□ 3.88
PNCK-208ENST00000422811 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.15■■■■□ 3.86
PNCK-208ENST00000422811 NCAPD3P42695 1498 aa38.21■■■■□ 3.71
PNCK-208ENST00000422811 SMARCA4P51532 1647 aa38.17■■■■□ 3.7
PNCK-208ENST00000422811 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.12■■■■□ 3.69
PNCK-208ENST00000422811 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
PNCK-208ENST00000422811 SMARCA2P51531 1590 aa38.06■■■■□ 3.68
PNCK-208ENST00000422811 HMGXB3Q12766 1538 aa37.93■■■■□ 3.66
PNCK-208ENST00000422811 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.8■■■■□ 3.64
PNCK-208ENST00000422811 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
PNCK-208ENST00000422811 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.78■■■■□ 3.64
PNCK-208ENST00000422811 ERCC6Q03468 1493 aa37.55■■■■□ 3.6
PNCK-208ENST00000422811 NESP48681 1621 aa37.46■■■■□ 3.59
PNCK-208ENST00000422811 CUX2O14529 1486 aa37.35■■■■□ 3.57
PNCK-208ENST00000422811 WIZO95785 1651 aa37.34■■■■□ 3.57
PNCK-208ENST00000422811 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.29■■■■□ 3.56
PNCK-208ENST00000422811 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.15■■■■□ 3.54
PNCK-208ENST00000422811 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.08■■■■□ 3.53
PNCK-208ENST00000422811 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.07■■■■□ 3.53
PNCK-208ENST00000422811 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
PNCK-208ENST00000422811 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.98■■■■□ 3.51
PNCK-208ENST00000422811 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.94■■■■□ 3.5
PNCK-208ENST00000422811 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
PNCK-208ENST00000422811 CFTRP13569 1480 aa36.71■■■■□ 3.47
PNCK-208ENST00000422811 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.71■■■■□ 3.47
PNCK-208ENST00000422811 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.64■■■■□ 3.46
PNCK-208ENST00000422811 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.63■■■■□ 3.45
PNCK-208ENST00000422811 WDR62O43379 1518 aa36.59■■■■□ 3.45
PNCK-208ENST00000422811 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.5■■■■□ 3.43
PNCK-208ENST00000422811 PRDM2Q13029 1718 aa36.34■■■■□ 3.41
PNCK-208ENST00000422811 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
PNCK-208ENST00000422811 TOPBP1Q92547 1522 aa35.97■■■■□ 3.35
PNCK-208ENST00000422811 ABCC8Q09428 1581 aa35.97■■■■□ 3.35
PNCK-208ENST00000422811 IFT140Q96RY7 1462 aa35.9■■■■□ 3.34
PNCK-208ENST00000422811 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.88■■■■□ 3.33
PNCK-208ENST00000422811 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
PNCK-208ENST00000422811 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
PNCK-208ENST00000422811 OSCARQ8IYS5 282 aa35.76■■■■□ 3.32
PNCK-208ENST00000422811 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
PNCK-208ENST00000422811 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
PNCK-208ENST00000422811 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
PNCK-208ENST00000422811 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.53■■■■□ 3.284e-8■■■■■ 27.4
PNCK-208ENST00000422811 SOGA1O94964 1423 aa35.5■■■■□ 3.27
PNCK-208ENST00000422811 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.49■■■■□ 3.27
PNCK-208ENST00000422811 CUX1P39880 1505 aa35.47■■■■□ 3.27
PNCK-208ENST00000422811 TRIM41Q8WV44 630 aa35.47■■■■□ 3.27
PNCK-208ENST00000422811 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.46■■■■□ 3.27
PNCK-208ENST00000422811 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
PNCK-208ENST00000422811 WDR97A6NE52 1622 aa35.3■■■■□ 3.24
PNCK-208ENST00000422811 FBLN2P98095 1184 aa35.27■■■■□ 3.24
PNCK-208ENST00000422811 CHD1O14646 1710 aa35.26■■■■□ 3.24
PNCK-208ENST00000422811 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.18■■■■□ 3.22
PNCK-208ENST00000422811 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.18■■■■□ 3.22
PNCK-208ENST00000422811 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.18■■■■□ 3.22
PNCK-208ENST00000422811 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.16■■■■□ 3.22
PNCK-208ENST00000422811 GRIN2BQ13224 1484 aa35.15■■■■□ 3.22
PNCK-208ENST00000422811 ARHGEF11O15085 1522 aa35.11■■■■□ 3.21
PNCK-208ENST00000422811 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
PNCK-208ENST00000422811 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.08■■■■□ 3.21
PNCK-208ENST00000422811 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
PNCK-208ENST00000422811 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.07■■■■□ 3.2
PNCK-208ENST00000422811 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.2
PNCK-208ENST00000422811 TOP2BQ02880 1626 aa35.03■■■■□ 3.2
PNCK-208ENST00000422811 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.01■■■■□ 3.19
PNCK-208ENST00000422811 PBRM1Q86U86 1689 aa35■■■■□ 3.19
PNCK-208ENST00000422811 SYNJ2O15056 1496 aa34.98■■■■□ 3.19
PNCK-208ENST00000422811 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.98■■■■□ 3.19
PNCK-208ENST00000422811 SYNJ1O43426 1573 aa34.97■■■■□ 3.19
PNCK-208ENST00000422811 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.89■■■■□ 3.18
PNCK-208ENST00000422811 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.87■■■■□ 3.17
PNCK-208ENST00000422811 ARAP1Q96P48 1450 aa34.78■■■■□ 3.16
PNCK-208ENST00000422811 ADAMTS12P58397 1594 aa34.69■■■■□ 3.14
PNCK-208ENST00000422811 GRIN2AQ12879 1464 aa34.68■■■■□ 3.14
PNCK-208ENST00000422811 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.65■■■■□ 3.14
PNCK-208ENST00000422811 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.64■■■■□ 3.14
PNCK-208ENST00000422811 NUP160Q12769 1436 aa34.55■■■■□ 3.12
PNCK-208ENST00000422811 CEP170Q5SW79 1584 aa34.52■■■■□ 3.12
PNCK-208ENST00000422811 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
PNCK-208ENST00000422811 KIF27Q86VH2 1401 aa34.38■■■■□ 3.09
PNCK-208ENST00000422811 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.35■■■■□ 3.09
PNCK-208ENST00000422811 SHROOM2Q13796 1616 aa34.34■■■■□ 3.09
PNCK-208ENST00000422811 IGF1RP08069 1367 aa34.31■■■■□ 3.08
PNCK-208ENST00000422811 JPH4Q96JJ6 628 aa34.24■■■■□ 3.07
PNCK-208ENST00000422811 CUL7Q14999 1698 aa34.22■■■■□ 3.07
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