RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.91■■□□□ 1.74
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SH3BP2-207ENST00000503393 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-207ENST00000503393 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-207ENST00000503393 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP2-207ENST00000503393 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-207ENST00000503393 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.21■■□□□ 1.47
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SH3BP2-207ENST00000503393 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP2-207ENST00000503393 APLP2Q06481 763 aa24.12■■□□□ 1.45
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SH3BP2-207ENST00000503393 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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SH3BP2-207ENST00000503393 HRCP23327 699 aa23.15■■□□□ 1.3
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SH3BP2-207ENST00000503393 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-207ENST00000503393 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.31■■□□□ 1.16
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SH3BP2-207ENST00000503393 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.04■□□□□ 0.96
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SH3BP2-207ENST00000503393 P3H3Q8IVL6 736 aa20.85■□□□□ 0.93
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SH3BP2-207ENST00000503393 FBLN2P98095 1184 aa20.77■□□□□ 0.92
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SH3BP2-207ENST00000503393 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-207ENST00000503393 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-207ENST00000503393 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.6■□□□□ 0.89
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SH3BP2-207ENST00000503393 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-207ENST00000503393 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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