RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466662.1

PNCK-223, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, human

TSL 3

Gene PNCK, Length 464 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNCK-223	ENST00000466662	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.22	■■■■■ 4.67
PNCK-223	ENST00000466662	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.51	■■■■□ 3.92
PNCK-223	ENST00000466662	ABCC9	O60706	1549 aa		38.64	■■■■□ 3.78
PNCK-223	ENST00000466662	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.18	■■■■□ 3.54
PNCK-223	ENST00000466662	NACAD	O15069	1562 aa		37.1	■■■■□ 3.53
PNCK-223	ENST00000466662	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.85	■■■■□ 3.49
PNCK-223	ENST00000466662	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	36.84	■■■■□ 3.49
PNCK-223	ENST00000466662	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.78	■■■■□ 3.48
PNCK-223	ENST00000466662	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.64	■■■■□ 3.46
PNCK-223	ENST00000466662	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.45	■■■■□ 3.43
PNCK-223	ENST00000466662	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.09	■■■■□ 3.37
PNCK-223	ENST00000466662	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.98	■■■■□ 3.35
PNCK-223	ENST00000466662	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.94	■■■■□ 3.34
PNCK-223	ENST00000466662	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.72	■■■■□ 3.31
PNCK-223	ENST00000466662	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.55	■■■■□ 3.28
PNCK-223	ENST00000466662	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.13	■■■■□ 3.21
PNCK-223	ENST00000466662	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.03	■■■■□ 3.2
PNCK-223	ENST00000466662	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.75	■■■■□ 3.15
PNCK-223	ENST00000466662	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.39	■■■■□ 3.1
PNCK-223	ENST00000466662	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.31	■■■■□ 3.08
PNCK-223	ENST00000466662	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.2	■■■■□ 3.06
PNCK-223	ENST00000466662	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.19	■■■■□ 3.06
PNCK-223	ENST00000466662	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.17	■■■■□ 3.06
PNCK-223	ENST00000466662	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.09	■■■■□ 3.05
PNCK-223	ENST00000466662	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.08	■■■■□ 3.05
PNCK-223	ENST00000466662	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.06	■■■■□ 3.04
PNCK-223	ENST00000466662	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.89	■■■■□ 3.02
PNCK-223	ENST00000466662	WIZ	O95785	1651 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PNCK-223	ENST00000466662	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
PNCK-223	ENST00000466662	NES	P48681	1621 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PNCK-223	ENST00000466662	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PNCK-223	ENST00000466662	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
PNCK-223	ENST00000466662	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PNCK-223	ENST00000466662	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PNCK-223	ENST00000466662	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PNCK-223	ENST00000466662	CUX2	O14529	1486 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PNCK-223	ENST00000466662	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PNCK-223	ENST00000466662	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PNCK-223	ENST00000466662	CFTR	P13569	1480 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PNCK-223	ENST00000466662	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PNCK-223	ENST00000466662	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PNCK-223	ENST00000466662	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PNCK-223	ENST00000466662	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PNCK-223	ENST00000466662	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PNCK-223	ENST00000466662	WDR62	O43379	1518 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PNCK-223	ENST00000466662	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
PNCK-223	ENST00000466662	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
PNCK-223	ENST00000466662	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PNCK-223	ENST00000466662	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PNCK-223	ENST00000466662	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PNCK-223	ENST00000466662	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PNCK-223	ENST00000466662	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PNCK-223	ENST00000466662	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PNCK-223	ENST00000466662	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PNCK-223	ENST00000466662	CUX1	P39880	1505 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PNCK-223	ENST00000466662	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PNCK-223	ENST00000466662	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PNCK-223	ENST00000466662	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PNCK-223	ENST00000466662	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PNCK-223	ENST00000466662	SOGA1	O94964	1423 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PNCK-223	ENST00000466662	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PNCK-223	ENST00000466662	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PNCK-223	ENST00000466662	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.72	■■■□□ 2.67	1e-8	■■■■■ 27.7
PNCK-223	ENST00000466662	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.7	■■■□□ 2.66
PNCK-223	ENST00000466662	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.67	■■■□□ 2.66
PNCK-223	ENST00000466662	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PNCK-223	ENST00000466662	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.61	■■■□□ 2.65
PNCK-223	ENST00000466662	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PNCK-223	ENST00000466662	CHD1	O14646	1710 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PNCK-223	ENST00000466662	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PNCK-223	ENST00000466662	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PNCK-223	ENST00000466662	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PNCK-223	ENST00000466662	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PNCK-223	ENST00000466662	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PNCK-223	ENST00000466662	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PNCK-223	ENST00000466662	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.62
PNCK-223	ENST00000466662	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PNCK-223	ENST00000466662	FBLN2	P98095	1184 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PNCK-223	ENST00000466662	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PNCK-223	ENST00000466662	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PNCK-223	ENST00000466662	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PNCK-223	ENST00000466662	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PNCK-223	ENST00000466662	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PNCK-223	ENST00000466662	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PNCK-223	ENST00000466662	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
PNCK-223	ENST00000466662	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PNCK-223	ENST00000466662	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PNCK-223	ENST00000466662	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PNCK-223	ENST00000466662	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PNCK-223	ENST00000466662	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PNCK-223	ENST00000466662	NUP160	Q12769	1436 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PNCK-223	ENST00000466662	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.96	■■■□□ 2.55
PNCK-223	ENST00000466662	CUL7	Q14999	1698 aa		30.95	■■■□□ 2.55
PNCK-223	ENST00000466662	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.9	■■■□□ 2.54
PNCK-223	ENST00000466662	IGF1R	P08069	1367 aa		30.88	■■■□□ 2.53
PNCK-223	ENST00000466662	SHROOM2	Q13796	1616 aa		30.84	■■■□□ 2.53
PNCK-223	ENST00000466662	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.79	■■■□□ 2.52
PNCK-223	ENST00000466662	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.74	■■■□□ 2.51
PNCK-223	ENST00000466662	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		30.71	■■■□□ 2.51
PNCK-223	ENST00000466662	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		30.68	■■■□□ 2.5

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