Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf17Q53FE4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4orf17Q53FE4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms