Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CREMQ03060 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CREMQ03060 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREMQ03060 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREMQ03060 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREMQ03060 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREMQ03060 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREMQ03060 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREMQ03060 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREMQ03060 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREMQ03060 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREMQ03060 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CREMQ03060 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CREMQ03060 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CREMQ03060 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CREMQ03060 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CREMQ03060 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CREMQ03060 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREMQ03060 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREMQ03060 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREMQ03060 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREMQ03060 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREMQ03060 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREMQ03060 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREMQ03060 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREMQ03060 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREMQ03060 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CREMQ03060 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREMQ03060 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREMQ03060 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREMQ03060 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREMQ03060 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREMQ03060 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CREMQ03060 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREMQ03060 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREMQ03060 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREMQ03060 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREMQ03060 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREMQ03060 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREMQ03060 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREMQ03060 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREMQ03060 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CREMQ03060 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms