Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SSFA2P28290 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SSFA2P28290 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SSFA2P28290 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms