Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCKDHBP21953 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BCKDHBP21953 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms