Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.18■■■■■ 6.42
DCAF1Q9Y4B6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC55.18■■■■■ 6.42
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.17■■■■■ 6.42
DCAF1Q9Y4B6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC55.11■■■■■ 6.41
DCAF1Q9Y4B6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC55.07■■■■■ 6.41
DCAF1Q9Y4B6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC55.05■■■■■ 6.4
DCAF1Q9Y4B6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.04■■■■■ 6.4
DCAF1Q9Y4B6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC54.99■■■■■ 6.39
DCAF1Q9Y4B6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.95■■■■■ 6.39
DCAF1Q9Y4B6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC54.92■■■■■ 6.38
DCAF1Q9Y4B6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC54.91■■■■■ 6.38
DCAF1Q9Y4B6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC54.91■■■■■ 6.38
DCAF1Q9Y4B6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC54.89■■■■■ 6.38
DCAF1Q9Y4B6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC54.82■■■■■ 6.37
DCAF1Q9Y4B6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC54.82■■■■■ 6.37
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.81■■■■■ 6.37
DCAF1Q9Y4B6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC54.79■■■■■ 6.36
DCAF1Q9Y4B6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.72■■■■■ 6.35
DCAF1Q9Y4B6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC54.69■■■■■ 6.35
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.67■■■■■ 6.34
DCAF1Q9Y4B6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC54.67■■■■■ 6.34
DCAF1Q9Y4B6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.65■■■■■ 6.34
DCAF1Q9Y4B6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.65■■■■■ 6.34
DCAF1Q9Y4B6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC54.63■■■■■ 6.34
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC54.62■■■■■ 6.33
DCAF1Q9Y4B6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC54.61■■■■■ 6.33
DCAF1Q9Y4B6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.6■■■■■ 6.33
DCAF1Q9Y4B6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC54.57■■■■■ 6.33
DCAF1Q9Y4B6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC54.57■■■■■ 6.33
DCAF1Q9Y4B6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC54.56■■■■■ 6.32
DCAF1Q9Y4B6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC54.56■■■■■ 6.32
DCAF1Q9Y4B6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC54.55■■■■■ 6.32
DCAF1Q9Y4B6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC54.54■■■■■ 6.32
DCAF1Q9Y4B6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC54.53■■■■■ 6.32
DCAF1Q9Y4B6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC54.5■■■■■ 6.32
DCAF1Q9Y4B6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC54.5■■■■■ 6.31
DCAF1Q9Y4B6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC54.48■■■■■ 6.31
DCAF1Q9Y4B6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC54.47■■■■■ 6.31
DCAF1Q9Y4B6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC54.45■■■■■ 6.31
DCAF1Q9Y4B6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.43■■■■■ 6.3
DCAF1Q9Y4B6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.41■■■■■ 6.3
DCAF1Q9Y4B6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC54.39■■■■■ 6.3
DCAF1Q9Y4B6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.36■■■■■ 6.29
DCAF1Q9Y4B6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC54.35■■■■■ 6.29
DCAF1Q9Y4B6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC54.35■■■■■ 6.29
DCAF1Q9Y4B6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
DCAF1Q9Y4B6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
DCAF1Q9Y4B6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC54.32■■■■■ 6.29
DCAF1Q9Y4B6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.32■■■■■ 6.29
DCAF1Q9Y4B6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC54.31■■■■■ 6.28
DCAF1Q9Y4B6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.3■■■■■ 6.28
DCAF1Q9Y4B6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.29■■■■■ 6.28
DCAF1Q9Y4B6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC54.29■■■■■ 6.28
DCAF1Q9Y4B6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC54.27■■■■■ 6.28
DCAF1Q9Y4B6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.27■■■■■ 6.28
DCAF1Q9Y4B6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC54.26■■■■■ 6.28
DCAF1Q9Y4B6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.26■■■■■ 6.28
DCAF1Q9Y4B6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.25■■■■■ 6.28
DCAF1Q9Y4B6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.25■■■■■ 6.28
DCAF1Q9Y4B6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC54.24■■■■■ 6.27
DCAF1Q9Y4B6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC54.24■■■■■ 6.27
DCAF1Q9Y4B6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.21■■■■■ 6.27
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC54.21■■■■■ 6.27
DCAF1Q9Y4B6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC54.19■■■■■ 6.27
DCAF1Q9Y4B6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC54.19■■■■■ 6.26
DCAF1Q9Y4B6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC54.18■■■■■ 6.26
DCAF1Q9Y4B6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC54.16■■■■■ 6.26
DCAF1Q9Y4B6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.15■■■■■ 6.26
DCAF1Q9Y4B6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
DCAF1Q9Y4B6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.12■■■■■ 6.25
DCAF1Q9Y4B6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC54.11■■■■■ 6.25
DCAF1Q9Y4B6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
DCAF1Q9Y4B6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC54.08■■■■■ 6.25
DCAF1Q9Y4B6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC54.06■■■■■ 6.24
DCAF1Q9Y4B6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
DCAF1Q9Y4B6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC54.01■■■■■ 6.24
DCAF1Q9Y4B6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC53.98■■■■■ 6.23
DCAF1Q9Y4B6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.95■■■■■ 6.23
DCAF1Q9Y4B6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.94■■■■■ 6.23
DCAF1Q9Y4B6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.94■■■■■ 6.22
DCAF1Q9Y4B6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.9■■■■■ 6.22
DCAF1Q9Y4B6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.9■■■■■ 6.22
DCAF1Q9Y4B6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.88■■■■■ 6.22
DCAF1Q9Y4B6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC53.88■■■■■ 6.22
DCAF1Q9Y4B6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.88■■■■■ 6.22
DCAF1Q9Y4B6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.85■■■■■ 6.21
DCAF1Q9Y4B6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC53.85■■■■■ 6.21
DCAF1Q9Y4B6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.84■■■■■ 6.21
DCAF1Q9Y4B6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC53.8■■■■■ 6.2
DCAF1Q9Y4B6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.77■■■■■ 6.2
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC53.75■■■■■ 6.2
DCAF1Q9Y4B6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC53.73■■■■■ 6.19
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.72■■■■■ 6.19
DCAF1Q9Y4B6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
DCAF1Q9Y4B6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
DCAF1Q9Y4B6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC53.71■■■■■ 6.19
DCAF1Q9Y4B6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.71■■■■■ 6.19
DCAF1Q9Y4B6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC53.69■■■■■ 6.19
DCAF1Q9Y4B6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC53.68■■■■■ 6.18
DCAF1Q9Y4B6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC53.68■■■■■ 6.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms