Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NFE2L3Q9Y4A8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NFE2L3Q9Y4A8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NFE2L3Q9Y4A8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NFE2L3Q9Y4A8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NFE2L3Q9Y4A8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NFE2L3Q9Y4A8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NFE2L3Q9Y4A8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NFE2L3Q9Y4A8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NFE2L3Q9Y4A8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFE2L3Q9Y4A8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NFE2L3Q9Y4A8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFE2L3Q9Y4A8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NFE2L3Q9Y4A8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFE2L3Q9Y4A8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NFE2L3Q9Y4A8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NFE2L3Q9Y4A8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFE2L3Q9Y4A8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NFE2L3Q9Y4A8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NFE2L3Q9Y4A8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NFE2L3Q9Y4A8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFE2L3Q9Y4A8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NFE2L3Q9Y4A8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFE2L3Q9Y4A8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NFE2L3Q9Y4A8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NFE2L3Q9Y4A8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NFE2L3Q9Y4A8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NFE2L3Q9Y4A8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFE2L3Q9Y4A8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFE2L3Q9Y4A8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NFE2L3Q9Y4A8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NFE2L3Q9Y4A8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NFE2L3Q9Y4A8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFE2L3Q9Y4A8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFE2L3Q9Y4A8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NFE2L3Q9Y4A8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NFE2L3Q9Y4A8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFE2L3Q9Y4A8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NFE2L3Q9Y4A8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFE2L3Q9Y4A8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFE2L3Q9Y4A8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NFE2L3Q9Y4A8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NFE2L3Q9Y4A8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NFE2L3Q9Y4A8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFE2L3Q9Y4A8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NFE2L3Q9Y4A8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NFE2L3Q9Y4A8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFE2L3Q9Y4A8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFE2L3Q9Y4A8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NFE2L3Q9Y4A8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NFE2L3Q9Y4A8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFE2L3Q9Y4A8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NFE2L3Q9Y4A8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFE2L3Q9Y4A8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFE2L3Q9Y4A8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NFE2L3Q9Y4A8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFE2L3Q9Y4A8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFE2L3Q9Y4A8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFE2L3Q9Y4A8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
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