Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SORCS3Q9UPU3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SORCS3Q9UPU3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SORCS3Q9UPU3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SORCS3Q9UPU3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SORCS3Q9UPU3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SORCS3Q9UPU3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SORCS3Q9UPU3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SORCS3Q9UPU3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SORCS3Q9UPU3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SORCS3Q9UPU3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SORCS3Q9UPU3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SORCS3Q9UPU3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SORCS3Q9UPU3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SORCS3Q9UPU3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SORCS3Q9UPU3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SORCS3Q9UPU3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SORCS3Q9UPU3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SORCS3Q9UPU3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SORCS3Q9UPU3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SORCS3Q9UPU3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SORCS3Q9UPU3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SORCS3Q9UPU3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SORCS3Q9UPU3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SORCS3Q9UPU3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SORCS3Q9UPU3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SORCS3Q9UPU3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SORCS3Q9UPU3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SORCS3Q9UPU3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SORCS3Q9UPU3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SORCS3Q9UPU3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SORCS3Q9UPU3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SORCS3Q9UPU3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SORCS3Q9UPU3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SORCS3Q9UPU3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SORCS3Q9UPU3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SORCS3Q9UPU3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SORCS3Q9UPU3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SORCS3Q9UPU3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SORCS3Q9UPU3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SORCS3Q9UPU3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SORCS3Q9UPU3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SORCS3Q9UPU3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SORCS3Q9UPU3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SORCS3Q9UPU3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SORCS3Q9UPU3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms