Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SCAF8Q9UPN6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SCAF8Q9UPN6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SCAF8Q9UPN6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF8Q9UPN6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF8Q9UPN6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF8Q9UPN6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SCAF8Q9UPN6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAF8Q9UPN6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAF8Q9UPN6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCAF8Q9UPN6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SCAF8Q9UPN6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF8Q9UPN6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SCAF8Q9UPN6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SCAF8Q9UPN6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF8Q9UPN6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SCAF8Q9UPN6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF8Q9UPN6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SCAF8Q9UPN6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SCAF8Q9UPN6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SCAF8Q9UPN6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SCAF8Q9UPN6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF8Q9UPN6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SCAF8Q9UPN6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAF8Q9UPN6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAF8Q9UPN6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SCAF8Q9UPN6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SCAF8Q9UPN6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SCAF8Q9UPN6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF8Q9UPN6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SCAF8Q9UPN6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SCAF8Q9UPN6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SCAF8Q9UPN6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF8Q9UPN6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF8Q9UPN6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF8Q9UPN6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SCAF8Q9UPN6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SCAF8Q9UPN6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF8Q9UPN6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SCAF8Q9UPN6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF8Q9UPN6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SCAF8Q9UPN6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SCAF8Q9UPN6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF8Q9UPN6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF8Q9UPN6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SCAF8Q9UPN6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SCAF8Q9UPN6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SCAF8Q9UPN6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SCAF8Q9UPN6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SCAF8Q9UPN6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SCAF8Q9UPN6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAF8Q9UPN6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAF8Q9UPN6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SCAF8Q9UPN6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAF8Q9UPN6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SCAF8Q9UPN6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCAF8Q9UPN6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SCAF8Q9UPN6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
SCAF8Q9UPN6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCAF8Q9UPN6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SCAF8Q9UPN6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SCAF8Q9UPN6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SCAF8Q9UPN6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SCAF8Q9UPN6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SCAF8Q9UPN6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
SCAF8Q9UPN6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SCAF8Q9UPN6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SCAF8Q9UPN6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAF8Q9UPN6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SCAF8Q9UPN6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms