Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNPO2Q9UMS6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNPO2Q9UMS6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SYNPO2Q9UMS6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SYNPO2Q9UMS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNPO2Q9UMS6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNPO2Q9UMS6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SYNPO2Q9UMS6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNPO2Q9UMS6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNPO2Q9UMS6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SYNPO2Q9UMS6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNPO2Q9UMS6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNPO2Q9UMS6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SYNPO2Q9UMS6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNPO2Q9UMS6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SYNPO2Q9UMS6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SYNPO2Q9UMS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SYNPO2Q9UMS6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SYNPO2Q9UMS6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SYNPO2Q9UMS6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SYNPO2Q9UMS6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SYNPO2Q9UMS6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SYNPO2Q9UMS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYNPO2Q9UMS6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SYNPO2Q9UMS6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SYNPO2Q9UMS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNPO2Q9UMS6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNPO2Q9UMS6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SYNPO2Q9UMS6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNPO2Q9UMS6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SYNPO2Q9UMS6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNPO2Q9UMS6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SYNPO2Q9UMS6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SYNPO2Q9UMS6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SYNPO2Q9UMS6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SYNPO2Q9UMS6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SYNPO2Q9UMS6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SYNPO2Q9UMS6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SYNPO2Q9UMS6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SYNPO2Q9UMS6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNPO2Q9UMS6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYNPO2Q9UMS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNPO2Q9UMS6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYNPO2Q9UMS6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYNPO2Q9UMS6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYNPO2Q9UMS6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYNPO2Q9UMS6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNPO2Q9UMS6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNPO2Q9UMS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNPO2Q9UMS6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYNPO2Q9UMS6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNPO2Q9UMS6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
SYNPO2Q9UMS6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNPO2Q9UMS6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNPO2Q9UMS6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNPO2Q9UMS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SYNPO2Q9UMS6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNPO2Q9UMS6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNPO2Q9UMS6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNPO2Q9UMS6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNPO2Q9UMS6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNPO2Q9UMS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SYNPO2Q9UMS6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SYNPO2Q9UMS6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SYNPO2Q9UMS6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNPO2Q9UMS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNPO2Q9UMS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYNPO2Q9UMS6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SYNPO2Q9UMS6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SYNPO2Q9UMS6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SYNPO2Q9UMS6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYNPO2Q9UMS6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SYNPO2Q9UMS6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNPO2Q9UMS6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SYNPO2Q9UMS6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SYNPO2Q9UMS6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SYNPO2Q9UMS6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SYNPO2Q9UMS6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SYNPO2Q9UMS6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SYNPO2Q9UMS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
SYNPO2Q9UMS6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SYNPO2Q9UMS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms