Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCC3Q9ULS5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCC3Q9ULS5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCC3Q9ULS5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCC3Q9ULS5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCC3Q9ULS5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCC3Q9ULS5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCC3Q9ULS5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCC3Q9ULS5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCC3Q9ULS5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCC3Q9ULS5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCC3Q9ULS5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCC3Q9ULS5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCC3Q9ULS5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC3Q9ULS5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC3Q9ULS5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC3Q9ULS5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCC3Q9ULS5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCC3Q9ULS5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCC3Q9ULS5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCC3Q9ULS5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCC3Q9ULS5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCC3Q9ULS5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCC3Q9ULS5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCC3Q9ULS5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCC3Q9ULS5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCC3Q9ULS5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCC3Q9ULS5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCC3Q9ULS5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCC3Q9ULS5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCC3Q9ULS5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCC3Q9ULS5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCC3Q9ULS5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCC3Q9ULS5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCC3Q9ULS5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCC3Q9ULS5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCC3Q9ULS5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCC3Q9ULS5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCC3Q9ULS5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCC3Q9ULS5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCC3Q9ULS5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCC3Q9ULS5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCC3Q9ULS5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCC3Q9ULS5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC3Q9ULS5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC3Q9ULS5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC3Q9ULS5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC3Q9ULS5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCC3Q9ULS5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCC3Q9ULS5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCC3Q9ULS5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCC3Q9ULS5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCC3Q9ULS5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCC3Q9ULS5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCC3Q9ULS5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCC3Q9ULS5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCC3Q9ULS5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCC3Q9ULS5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCC3Q9ULS5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCC3Q9ULS5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCC3Q9ULS5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCC3Q9ULS5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCC3Q9ULS5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCC3Q9ULS5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCC3Q9ULS5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCC3Q9ULS5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMCC3Q9ULS5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMCC3Q9ULS5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCC3Q9ULS5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCC3Q9ULS5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMCC3Q9ULS5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMCC3Q9ULS5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMCC3Q9ULS5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCC3Q9ULS5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCC3Q9ULS5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMCC3Q9ULS5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMCC3Q9ULS5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms