Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.08■■■■■ 4.97
TNIKQ9UKE5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC46.07■■■■■ 4.97
TNIKQ9UKE5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
TNIKQ9UKE5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
TNIKQ9UKE5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
TNIKQ9UKE5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC46.02■■■■■ 4.96
TNIKQ9UKE5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
TNIKQ9UKE5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
TNIKQ9UKE5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
TNIKQ9UKE5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
TNIKQ9UKE5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
TNIKQ9UKE5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
TNIKQ9UKE5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
TNIKQ9UKE5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
TNIKQ9UKE5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
TNIKQ9UKE5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
TNIKQ9UKE5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
TNIKQ9UKE5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TNIKQ9UKE5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC45.81■■■■■ 4.92
TNIKQ9UKE5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
TNIKQ9UKE5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
TNIKQ9UKE5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
TNIKQ9UKE5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.78■■■■■ 4.92
TNIKQ9UKE5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC45.77■■■■■ 4.92
TNIKQ9UKE5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
TNIKQ9UKE5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
TNIKQ9UKE5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
TNIKQ9UKE5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
TNIKQ9UKE5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
TNIKQ9UKE5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
TNIKQ9UKE5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
TNIKQ9UKE5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
TNIKQ9UKE5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
TNIKQ9UKE5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC45.67■■■■■ 4.9
TNIKQ9UKE5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
TNIKQ9UKE5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC45.63■■■■■ 4.9
TNIKQ9UKE5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
TNIKQ9UKE5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
TNIKQ9UKE5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
TNIKQ9UKE5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
TNIKQ9UKE5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
TNIKQ9UKE5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
TNIKQ9UKE5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
TNIKQ9UKE5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
TNIKQ9UKE5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
TNIKQ9UKE5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
TNIKQ9UKE5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
TNIKQ9UKE5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
TNIKQ9UKE5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
TNIKQ9UKE5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
TNIKQ9UKE5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
TNIKQ9UKE5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
TNIKQ9UKE5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
TNIKQ9UKE5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
TNIKQ9UKE5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
TNIKQ9UKE5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
TNIKQ9UKE5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
TNIKQ9UKE5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
TNIKQ9UKE5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC45.33■■■■■ 4.85
TNIKQ9UKE5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC45.33■■■■■ 4.85
TNIKQ9UKE5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.84
TNIKQ9UKE5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
TNIKQ9UKE5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
TNIKQ9UKE5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
TNIKQ9UKE5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
TNIKQ9UKE5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
TNIKQ9UKE5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
TNIKQ9UKE5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
TNIKQ9UKE5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
TNIKQ9UKE5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
TNIKQ9UKE5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
TNIKQ9UKE5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
TNIKQ9UKE5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
TNIKQ9UKE5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
TNIKQ9UKE5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
TNIKQ9UKE5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
TNIKQ9UKE5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
TNIKQ9UKE5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
TNIKQ9UKE5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
TNIKQ9UKE5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
TNIKQ9UKE5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
TNIKQ9UKE5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.8
TNIKQ9UKE5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
TNIKQ9UKE5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
TNIKQ9UKE5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
TNIKQ9UKE5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
TNIKQ9UKE5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC45.01■■■■■ 4.8
TNIKQ9UKE5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.96■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC44.94■■■■■ 4.79
TNIKQ9UKE5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
TNIKQ9UKE5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms