Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAX2Q9UIW0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAX2Q9UIW0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAX2Q9UIW0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAX2Q9UIW0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAX2Q9UIW0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAX2Q9UIW0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAX2Q9UIW0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAX2Q9UIW0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAX2Q9UIW0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAX2Q9UIW0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAX2Q9UIW0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAX2Q9UIW0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAX2Q9UIW0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAX2Q9UIW0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAX2Q9UIW0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAX2Q9UIW0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAX2Q9UIW0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAX2Q9UIW0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VAX2Q9UIW0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAX2Q9UIW0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAX2Q9UIW0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAX2Q9UIW0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAX2Q9UIW0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAX2Q9UIW0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAX2Q9UIW0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAX2Q9UIW0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VAX2Q9UIW0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAX2Q9UIW0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAX2Q9UIW0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAX2Q9UIW0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms