Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
USP25Q9UHP3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
USP25Q9UHP3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
USP25Q9UHP3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
USP25Q9UHP3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
USP25Q9UHP3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
USP25Q9UHP3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
USP25Q9UHP3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
USP25Q9UHP3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
USP25Q9UHP3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
USP25Q9UHP3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
USP25Q9UHP3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
USP25Q9UHP3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
USP25Q9UHP3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP25Q9UHP3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP25Q9UHP3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP25Q9UHP3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
USP25Q9UHP3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
USP25Q9UHP3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
USP25Q9UHP3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
USP25Q9UHP3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
USP25Q9UHP3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
USP25Q9UHP3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
USP25Q9UHP3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
USP25Q9UHP3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
USP25Q9UHP3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
USP25Q9UHP3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
USP25Q9UHP3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
USP25Q9UHP3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
USP25Q9UHP3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
USP25Q9UHP3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
USP25Q9UHP3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
USP25Q9UHP3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
USP25Q9UHP3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
USP25Q9UHP3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
USP25Q9UHP3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
USP25Q9UHP3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
USP25Q9UHP3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
USP25Q9UHP3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
USP25Q9UHP3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
USP25Q9UHP3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
USP25Q9UHP3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
USP25Q9UHP3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
USP25Q9UHP3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
USP25Q9UHP3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
USP25Q9UHP3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
USP25Q9UHP3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
USP25Q9UHP3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
USP25Q9UHP3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
USP25Q9UHP3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP25Q9UHP3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP25Q9UHP3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP25Q9UHP3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
USP25Q9UHP3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
USP25Q9UHP3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
USP25Q9UHP3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
USP25Q9UHP3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP25Q9UHP3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
USP25Q9UHP3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
USP25Q9UHP3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
USP25Q9UHP3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP25Q9UHP3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
USP25Q9UHP3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
USP25Q9UHP3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
USP25Q9UHP3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
USP25Q9UHP3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
USP25Q9UHP3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
USP25Q9UHP3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
USP25Q9UHP3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP25Q9UHP3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
USP25Q9UHP3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
USP25Q9UHP3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP25Q9UHP3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP25Q9UHP3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
USP25Q9UHP3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
USP25Q9UHP3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms