Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHORDC1Q9UHD1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHORDC1Q9UHD1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHORDC1Q9UHD1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHORDC1Q9UHD1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHORDC1Q9UHD1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHORDC1Q9UHD1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHORDC1Q9UHD1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHORDC1Q9UHD1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHORDC1Q9UHD1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHORDC1Q9UHD1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHORDC1Q9UHD1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHORDC1Q9UHD1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHORDC1Q9UHD1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHORDC1Q9UHD1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHORDC1Q9UHD1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHORDC1Q9UHD1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHORDC1Q9UHD1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHORDC1Q9UHD1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHORDC1Q9UHD1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHORDC1Q9UHD1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHORDC1Q9UHD1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHORDC1Q9UHD1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHORDC1Q9UHD1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHORDC1Q9UHD1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHORDC1Q9UHD1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHORDC1Q9UHD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHORDC1Q9UHD1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHORDC1Q9UHD1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CHORDC1Q9UHD1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHORDC1Q9UHD1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHORDC1Q9UHD1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHORDC1Q9UHD1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CHORDC1Q9UHD1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHORDC1Q9UHD1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHORDC1Q9UHD1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHORDC1Q9UHD1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHORDC1Q9UHD1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHORDC1Q9UHD1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHORDC1Q9UHD1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHORDC1Q9UHD1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHORDC1Q9UHD1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHORDC1Q9UHD1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHORDC1Q9UHD1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHORDC1Q9UHD1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHORDC1Q9UHD1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHORDC1Q9UHD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHORDC1Q9UHD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHORDC1Q9UHD1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHORDC1Q9UHD1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms