Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CGNQ9P2M7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CGNQ9P2M7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CGNQ9P2M7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CGNQ9P2M7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CGNQ9P2M7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CGNQ9P2M7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CGNQ9P2M7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CGNQ9P2M7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CGNQ9P2M7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CGNQ9P2M7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CGNQ9P2M7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CGNQ9P2M7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CGNQ9P2M7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CGNQ9P2M7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CGNQ9P2M7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CGNQ9P2M7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNQ9P2M7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CGNQ9P2M7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CGNQ9P2M7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CGNQ9P2M7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CGNQ9P2M7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CGNQ9P2M7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CGNQ9P2M7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CGNQ9P2M7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CGNQ9P2M7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CGNQ9P2M7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CGNQ9P2M7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CGNQ9P2M7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CGNQ9P2M7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CGNQ9P2M7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CGNQ9P2M7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CGNQ9P2M7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CGNQ9P2M7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CGNQ9P2M7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CGNQ9P2M7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CGNQ9P2M7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CGNQ9P2M7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CGNQ9P2M7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CGNQ9P2M7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CGNQ9P2M7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CGNQ9P2M7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CGNQ9P2M7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CGNQ9P2M7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CGNQ9P2M7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CGNQ9P2M7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CGNQ9P2M7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNQ9P2M7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNQ9P2M7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CGNQ9P2M7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CGNQ9P2M7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CGNQ9P2M7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNQ9P2M7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CGNQ9P2M7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms