Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GGA3Q9NZ52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GGA3Q9NZ52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GGA3Q9NZ52 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GGA3Q9NZ52 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
GGA3Q9NZ52 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GGA3Q9NZ52 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GGA3Q9NZ52 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
GGA3Q9NZ52 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GGA3Q9NZ52 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GGA3Q9NZ52 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GGA3Q9NZ52 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
GGA3Q9NZ52 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
GGA3Q9NZ52 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GGA3Q9NZ52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GGA3Q9NZ52 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GGA3Q9NZ52 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GGA3Q9NZ52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GGA3Q9NZ52 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GGA3Q9NZ52 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GGA3Q9NZ52 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GGA3Q9NZ52 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
GGA3Q9NZ52 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GGA3Q9NZ52 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
GGA3Q9NZ52 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
GGA3Q9NZ52 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GGA3Q9NZ52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GGA3Q9NZ52 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GGA3Q9NZ52 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GGA3Q9NZ52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GGA3Q9NZ52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GGA3Q9NZ52 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GGA3Q9NZ52 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GGA3Q9NZ52 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GGA3Q9NZ52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GGA3Q9NZ52 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GGA3Q9NZ52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GGA3Q9NZ52 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GGA3Q9NZ52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms