Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA2D2Q9NY47 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA2D2Q9NY47 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA2D2Q9NY47 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA2D2Q9NY47 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNA2D2Q9NY47 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D2Q9NY47 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D2Q9NY47 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D2Q9NY47 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D2Q9NY47 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D2Q9NY47 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA2D2Q9NY47 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA2D2Q9NY47 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA2D2Q9NY47 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D2Q9NY47 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D2Q9NY47 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D2Q9NY47 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D2Q9NY47 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D2Q9NY47 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D2Q9NY47 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNA2D2Q9NY47 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA2D2Q9NY47 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA2D2Q9NY47 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D2Q9NY47 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNA2D2Q9NY47 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA2D2Q9NY47 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNA2D2Q9NY47 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNA2D2Q9NY47 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA2D2Q9NY47 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA2D2Q9NY47 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNA2D2Q9NY47 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNA2D2Q9NY47 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNA2D2Q9NY47 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CACNA2D2Q9NY47 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNA2D2Q9NY47 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNA2D2Q9NY47 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNA2D2Q9NY47 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA2D2Q9NY47 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA2D2Q9NY47 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNA2D2Q9NY47 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D2Q9NY47 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNA2D2Q9NY47 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNA2D2Q9NY47 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D2Q9NY47 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D2Q9NY47 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D2Q9NY47 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA2D2Q9NY47 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA2D2Q9NY47 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA2D2Q9NY47 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNA2D2Q9NY47 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNA2D2Q9NY47 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms