Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR3BQ9NW08 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3BQ9NW08 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3BQ9NW08 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3BQ9NW08 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3BQ9NW08 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3BQ9NW08 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3BQ9NW08 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3BQ9NW08 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3BQ9NW08 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3BQ9NW08 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3BQ9NW08 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3BQ9NW08 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3BQ9NW08 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3BQ9NW08 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3BQ9NW08 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3BQ9NW08 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLR3BQ9NW08 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3BQ9NW08 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLR3BQ9NW08 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3BQ9NW08 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POLR3BQ9NW08 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLR3BQ9NW08 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLR3BQ9NW08 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR3BQ9NW08 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR3BQ9NW08 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3BQ9NW08 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR3BQ9NW08 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3BQ9NW08 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3BQ9NW08 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3BQ9NW08 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3BQ9NW08 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3BQ9NW08 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3BQ9NW08 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3BQ9NW08 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3BQ9NW08 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3BQ9NW08 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3BQ9NW08 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3BQ9NW08 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3BQ9NW08 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLR3BQ9NW08 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLR3BQ9NW08 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR3BQ9NW08 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3BQ9NW08 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR3BQ9NW08 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3BQ9NW08 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3BQ9NW08 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3BQ9NW08 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR3BQ9NW08 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3BQ9NW08 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR3BQ9NW08 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3BQ9NW08 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3BQ9NW08 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3BQ9NW08 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR3BQ9NW08 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3BQ9NW08 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3BQ9NW08 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR3BQ9NW08 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3BQ9NW08 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR3BQ9NW08 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR3BQ9NW08 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR3BQ9NW08 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3BQ9NW08 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR3BQ9NW08 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3BQ9NW08 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR3BQ9NW08 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR3BQ9NW08 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR3BQ9NW08 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR3BQ9NW08 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR3BQ9NW08 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR3BQ9NW08 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3BQ9NW08 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3BQ9NW08 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR3BQ9NW08 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR3BQ9NW08 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms