Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP9

LIN7C, Protein lin-7 homolog C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7CQ9NUP9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN7CQ9NUP9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7CQ9NUP9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7CQ9NUP9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN7CQ9NUP9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN7CQ9NUP9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7CQ9NUP9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7CQ9NUP9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7CQ9NUP9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN7CQ9NUP9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN7CQ9NUP9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN7CQ9NUP9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7CQ9NUP9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN7CQ9NUP9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN7CQ9NUP9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7CQ9NUP9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LIN7CQ9NUP9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7CQ9NUP9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7CQ9NUP9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIN7CQ9NUP9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIN7CQ9NUP9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7CQ9NUP9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIN7CQ9NUP9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7CQ9NUP9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7CQ9NUP9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIN7CQ9NUP9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIN7CQ9NUP9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7CQ9NUP9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7CQ9NUP9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIN7CQ9NUP9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LIN7CQ9NUP9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LIN7CQ9NUP9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LIN7CQ9NUP9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms