Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL5

RYDEN, Repressor of yield of DENV protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYDENQ9NUL5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RYDENQ9NUL5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RYDENQ9NUL5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RYDENQ9NUL5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RYDENQ9NUL5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RYDENQ9NUL5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RYDENQ9NUL5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RYDENQ9NUL5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RYDENQ9NUL5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RYDENQ9NUL5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RYDENQ9NUL5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RYDENQ9NUL5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RYDENQ9NUL5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RYDENQ9NUL5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RYDENQ9NUL5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RYDENQ9NUL5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RYDENQ9NUL5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RYDENQ9NUL5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RYDENQ9NUL5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RYDENQ9NUL5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RYDENQ9NUL5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RYDENQ9NUL5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RYDENQ9NUL5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RYDENQ9NUL5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RYDENQ9NUL5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RYDENQ9NUL5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RYDENQ9NUL5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RYDENQ9NUL5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RYDENQ9NUL5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RYDENQ9NUL5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RYDENQ9NUL5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RYDENQ9NUL5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RYDENQ9NUL5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RYDENQ9NUL5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RYDENQ9NUL5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RYDENQ9NUL5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RYDENQ9NUL5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms