Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNIP2Q9NS61 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNIP2Q9NS61 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNIP2Q9NS61 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNIP2Q9NS61 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNIP2Q9NS61 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNIP2Q9NS61 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNIP2Q9NS61 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNIP2Q9NS61 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNIP2Q9NS61 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNIP2Q9NS61 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNIP2Q9NS61 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNIP2Q9NS61 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNIP2Q9NS61 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNIP2Q9NS61 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNIP2Q9NS61 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNIP2Q9NS61 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNIP2Q9NS61 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNIP2Q9NS61 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNIP2Q9NS61 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNIP2Q9NS61 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNIP2Q9NS61 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNIP2Q9NS61 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNIP2Q9NS61 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNIP2Q9NS61 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNIP2Q9NS61 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNIP2Q9NS61 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNIP2Q9NS61 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNIP2Q9NS61 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP2Q9NS61 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP2Q9NS61 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNIP2Q9NS61 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNIP2Q9NS61 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNIP2Q9NS61 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNIP2Q9NS61 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNIP2Q9NS61 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNIP2Q9NS61 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP2Q9NS61 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP2Q9NS61 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNIP2Q9NS61 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNIP2Q9NS61 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNIP2Q9NS61 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNIP2Q9NS61 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNIP2Q9NS61 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNIP2Q9NS61 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNIP2Q9NS61 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNIP2Q9NS61 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNIP2Q9NS61 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNIP2Q9NS61 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNIP2Q9NS61 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNIP2Q9NS61 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNIP2Q9NS61 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNIP2Q9NS61 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP2Q9NS61 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNIP2Q9NS61 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNIP2Q9NS61 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNIP2Q9NS61 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms