Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB16Q9NRJ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCDHB16Q9NRJ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCDHB16Q9NRJ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCDHB16Q9NRJ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCDHB16Q9NRJ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PCDHB16Q9NRJ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB16Q9NRJ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCDHB16Q9NRJ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCDHB16Q9NRJ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB16Q9NRJ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCDHB16Q9NRJ7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHB16Q9NRJ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCDHB16Q9NRJ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHB16Q9NRJ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCDHB16Q9NRJ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHB16Q9NRJ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHB16Q9NRJ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCDHB16Q9NRJ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCDHB16Q9NRJ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCDHB16Q9NRJ7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB16Q9NRJ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB16Q9NRJ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB16Q9NRJ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB16Q9NRJ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB16Q9NRJ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB16Q9NRJ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB16Q9NRJ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB16Q9NRJ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB16Q9NRJ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB16Q9NRJ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB16Q9NRJ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB16Q9NRJ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB16Q9NRJ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB16Q9NRJ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB16Q9NRJ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB16Q9NRJ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB16Q9NRJ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB16Q9NRJ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB16Q9NRJ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB16Q9NRJ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB16Q9NRJ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms