Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SEC31BQ9NQW1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SEC31BQ9NQW1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SEC31BQ9NQW1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SEC31BQ9NQW1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SEC31BQ9NQW1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SEC31BQ9NQW1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SEC31BQ9NQW1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SEC31BQ9NQW1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SEC31BQ9NQW1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
SEC31BQ9NQW1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SEC31BQ9NQW1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SEC31BQ9NQW1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SEC31BQ9NQW1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SEC31BQ9NQW1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SEC31BQ9NQW1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SEC31BQ9NQW1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SEC31BQ9NQW1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SEC31BQ9NQW1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SEC31BQ9NQW1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SEC31BQ9NQW1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SEC31BQ9NQW1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SEC31BQ9NQW1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SEC31BQ9NQW1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SEC31BQ9NQW1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SEC31BQ9NQW1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SEC31BQ9NQW1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SEC31BQ9NQW1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SEC31BQ9NQW1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SEC31BQ9NQW1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SEC31BQ9NQW1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SEC31BQ9NQW1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SEC31BQ9NQW1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SEC31BQ9NQW1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SEC31BQ9NQW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SEC31BQ9NQW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SEC31BQ9NQW1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SEC31BQ9NQW1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SEC31BQ9NQW1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SEC31BQ9NQW1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SEC31BQ9NQW1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SEC31BQ9NQW1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SEC31BQ9NQW1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SEC31BQ9NQW1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SEC31BQ9NQW1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SEC31BQ9NQW1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SEC31BQ9NQW1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SEC31BQ9NQW1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SEC31BQ9NQW1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SEC31BQ9NQW1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SEC31BQ9NQW1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SEC31BQ9NQW1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SEC31BQ9NQW1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SEC31BQ9NQW1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SEC31BQ9NQW1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SEC31BQ9NQW1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SEC31BQ9NQW1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SEC31BQ9NQW1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SEC31BQ9NQW1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SEC31BQ9NQW1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SEC31BQ9NQW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SEC31BQ9NQW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SEC31BQ9NQW1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SEC31BQ9NQW1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SEC31BQ9NQW1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SEC31BQ9NQW1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SEC31BQ9NQW1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SEC31BQ9NQW1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SEC31BQ9NQW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SEC31BQ9NQW1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SEC31BQ9NQW1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SEC31BQ9NQW1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SEC31BQ9NQW1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SEC31BQ9NQW1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SEC31BQ9NQW1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SEC31BQ9NQW1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SEC31BQ9NQW1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SEC31BQ9NQW1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SEC31BQ9NQW1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SEC31BQ9NQW1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SEC31BQ9NQW1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SEC31BQ9NQW1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SEC31BQ9NQW1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SEC31BQ9NQW1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SEC31BQ9NQW1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SEC31BQ9NQW1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SEC31BQ9NQW1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms