Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC8

IFT46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT46Q9NQC8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT46Q9NQC8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFT46Q9NQC8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFT46Q9NQC8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFT46Q9NQC8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT46Q9NQC8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFT46Q9NQC8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
IFT46Q9NQC8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFT46Q9NQC8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT46Q9NQC8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT46Q9NQC8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT46Q9NQC8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFT46Q9NQC8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFT46Q9NQC8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT46Q9NQC8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFT46Q9NQC8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IFT46Q9NQC8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT46Q9NQC8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IFT46Q9NQC8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT46Q9NQC8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT46Q9NQC8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT46Q9NQC8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT46Q9NQC8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT46Q9NQC8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT46Q9NQC8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT46Q9NQC8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT46Q9NQC8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT46Q9NQC8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT46Q9NQC8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT46Q9NQC8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT46Q9NQC8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT46Q9NQC8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT46Q9NQC8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT46Q9NQC8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFT46Q9NQC8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT46Q9NQC8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFT46Q9NQC8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFT46Q9NQC8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT46Q9NQC8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT46Q9NQC8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT46Q9NQC8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT46Q9NQC8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT46Q9NQC8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT46Q9NQC8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT46Q9NQC8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFT46Q9NQC8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT46Q9NQC8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT46Q9NQC8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms