Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNPLA8Q9NP80 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PNPLA8Q9NP80 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PNPLA8Q9NP80 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PNPLA8Q9NP80 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PNPLA8Q9NP80 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNPLA8Q9NP80 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNPLA8Q9NP80 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNPLA8Q9NP80 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNPLA8Q9NP80 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNPLA8Q9NP80 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNPLA8Q9NP80 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNPLA8Q9NP80 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PNPLA8Q9NP80 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PNPLA8Q9NP80 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PNPLA8Q9NP80 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNPLA8Q9NP80 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNPLA8Q9NP80 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNPLA8Q9NP80 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNPLA8Q9NP80 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNPLA8Q9NP80 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNPLA8Q9NP80 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PNPLA8Q9NP80 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNPLA8Q9NP80 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNPLA8Q9NP80 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PNPLA8Q9NP80 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PNPLA8Q9NP80 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PNPLA8Q9NP80 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNPLA8Q9NP80 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNPLA8Q9NP80 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNPLA8Q9NP80 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNPLA8Q9NP80 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNPLA8Q9NP80 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNPLA8Q9NP80 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNPLA8Q9NP80 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNPLA8Q9NP80 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNPLA8Q9NP80 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNPLA8Q9NP80 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNPLA8Q9NP80 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNPLA8Q9NP80 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PNPLA8Q9NP80 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNPLA8Q9NP80 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNPLA8Q9NP80 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PNPLA8Q9NP80 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNPLA8Q9NP80 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PNPLA8Q9NP80 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNPLA8Q9NP80 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNPLA8Q9NP80 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNPLA8Q9NP80 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNPLA8Q9NP80 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PNPLA8Q9NP80 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PNPLA8Q9NP80 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNPLA8Q9NP80 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNPLA8Q9NP80 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNPLA8Q9NP80 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNPLA8Q9NP80 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNPLA8Q9NP80 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNPLA8Q9NP80 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNPLA8Q9NP80 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNPLA8Q9NP80 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNPLA8Q9NP80 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PNPLA8Q9NP80 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms