Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUDS3Q9H7L9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUDS3Q9H7L9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SUDS3Q9H7L9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SUDS3Q9H7L9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUDS3Q9H7L9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUDS3Q9H7L9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SUDS3Q9H7L9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SUDS3Q9H7L9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SUDS3Q9H7L9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SUDS3Q9H7L9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUDS3Q9H7L9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUDS3Q9H7L9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SUDS3Q9H7L9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SUDS3Q9H7L9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SUDS3Q9H7L9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SUDS3Q9H7L9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUDS3Q9H7L9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUDS3Q9H7L9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SUDS3Q9H7L9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SUDS3Q9H7L9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SUDS3Q9H7L9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUDS3Q9H7L9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUDS3Q9H7L9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SUDS3Q9H7L9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SUDS3Q9H7L9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SUDS3Q9H7L9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SUDS3Q9H7L9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUDS3Q9H7L9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUDS3Q9H7L9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SUDS3Q9H7L9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SUDS3Q9H7L9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SUDS3Q9H7L9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUDS3Q9H7L9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SUDS3Q9H7L9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUDS3Q9H7L9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUDS3Q9H7L9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUDS3Q9H7L9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUDS3Q9H7L9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUDS3Q9H7L9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUDS3Q9H7L9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SUDS3Q9H7L9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUDS3Q9H7L9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUDS3Q9H7L9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUDS3Q9H7L9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SUDS3Q9H7L9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SUDS3Q9H7L9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SUDS3Q9H7L9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms