Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C5orf42Q9H799 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
C5orf42Q9H799 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
C5orf42Q9H799 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C5orf42Q9H799 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
C5orf42Q9H799 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C5orf42Q9H799 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
C5orf42Q9H799 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C5orf42Q9H799 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C5orf42Q9H799 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
C5orf42Q9H799 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
C5orf42Q9H799 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C5orf42Q9H799 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
C5orf42Q9H799 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C5orf42Q9H799 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C5orf42Q9H799 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
C5orf42Q9H799 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C5orf42Q9H799 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
C5orf42Q9H799 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C5orf42Q9H799 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C5orf42Q9H799 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
C5orf42Q9H799 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C5orf42Q9H799 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
C5orf42Q9H799 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C5orf42Q9H799 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C5orf42Q9H799 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C5orf42Q9H799 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
C5orf42Q9H799 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C5orf42Q9H799 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C5orf42Q9H799 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C5orf42Q9H799 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C5orf42Q9H799 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C5orf42Q9H799 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C5orf42Q9H799 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
C5orf42Q9H799 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C5orf42Q9H799 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
C5orf42Q9H799 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C5orf42Q9H799 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C5orf42Q9H799 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C5orf42Q9H799 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C5orf42Q9H799 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C5orf42Q9H799 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C5orf42Q9H799 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C5orf42Q9H799 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C5orf42Q9H799 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C5orf42Q9H799 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C5orf42Q9H799 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C5orf42Q9H799 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C5orf42Q9H799 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C5orf42Q9H799 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C5orf42Q9H799 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C5orf42Q9H799 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
C5orf42Q9H799 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms