Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA4CQ9C0C4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA4CQ9C0C4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA4CQ9C0C4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEMA4CQ9C0C4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA4CQ9C0C4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4CQ9C0C4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA4CQ9C0C4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA4CQ9C0C4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA4CQ9C0C4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4CQ9C0C4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4CQ9C0C4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SEMA4CQ9C0C4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEMA4CQ9C0C4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA4CQ9C0C4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SEMA4CQ9C0C4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4CQ9C0C4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEMA4CQ9C0C4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4CQ9C0C4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA4CQ9C0C4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4CQ9C0C4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4CQ9C0C4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4CQ9C0C4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4CQ9C0C4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA4CQ9C0C4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4CQ9C0C4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4CQ9C0C4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA4CQ9C0C4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA4CQ9C0C4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA4CQ9C0C4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4CQ9C0C4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA4CQ9C0C4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SEMA4CQ9C0C4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA4CQ9C0C4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA4CQ9C0C4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA4CQ9C0C4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA4CQ9C0C4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA4CQ9C0C4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4CQ9C0C4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4CQ9C0C4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEMA4CQ9C0C4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA4CQ9C0C4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA4CQ9C0C4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA4CQ9C0C4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4CQ9C0C4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4CQ9C0C4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4CQ9C0C4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4CQ9C0C4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SEMA4CQ9C0C4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA4CQ9C0C4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4CQ9C0C4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4CQ9C0C4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4CQ9C0C4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA4CQ9C0C4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4CQ9C0C4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4CQ9C0C4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4CQ9C0C4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4CQ9C0C4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA4CQ9C0C4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4CQ9C0C4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms