Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP3Q9BZ76 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP3Q9BZ76 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP3Q9BZ76 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP3Q9BZ76 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNTNAP3Q9BZ76 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CNTNAP3Q9BZ76 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CNTNAP3Q9BZ76 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP3Q9BZ76 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP3Q9BZ76 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CNTNAP3Q9BZ76 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CNTNAP3Q9BZ76 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP3Q9BZ76 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CNTNAP3Q9BZ76 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNTNAP3Q9BZ76 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP3Q9BZ76 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNTNAP3Q9BZ76 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP3Q9BZ76 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNTNAP3Q9BZ76 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNTNAP3Q9BZ76 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP3Q9BZ76 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP3Q9BZ76 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP3Q9BZ76 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP3Q9BZ76 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP3Q9BZ76 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CNTNAP3Q9BZ76 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP3Q9BZ76 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNTNAP3Q9BZ76 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNTNAP3Q9BZ76 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNTNAP3Q9BZ76 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP3Q9BZ76 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP3Q9BZ76 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTNAP3Q9BZ76 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTNAP3Q9BZ76 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP3Q9BZ76 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTNAP3Q9BZ76 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP3Q9BZ76 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTNAP3Q9BZ76 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP3Q9BZ76 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTNAP3Q9BZ76 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNTNAP3Q9BZ76 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP3Q9BZ76 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP3Q9BZ76 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNTNAP3Q9BZ76 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP3Q9BZ76 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP3Q9BZ76 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP3Q9BZ76 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP3Q9BZ76 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP3Q9BZ76 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP3Q9BZ76 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP3Q9BZ76 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP3Q9BZ76 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP3Q9BZ76 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP3Q9BZ76 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP3Q9BZ76 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP3Q9BZ76 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP3Q9BZ76 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP3Q9BZ76 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP3Q9BZ76 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP3Q9BZ76 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP3Q9BZ76 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP3Q9BZ76 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP3Q9BZ76 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP3Q9BZ76 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP3Q9BZ76 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP3Q9BZ76 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTNAP3Q9BZ76 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNTNAP3Q9BZ76 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNTNAP3Q9BZ76 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP3Q9BZ76 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CNTNAP3Q9BZ76 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CNTNAP3Q9BZ76 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CNTNAP3Q9BZ76 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CNTNAP3Q9BZ76 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CNTNAP3Q9BZ76 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms