Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF3

CECR2, Cat eye syndrome critical region protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CECR2Q9BXF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
CECR2Q9BXF3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC52.75■■■■■ 6.04
CECR2Q9BXF3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
CECR2Q9BXF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC52.7■■■■■ 6.03
CECR2Q9BXF3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC52.69■■■■■ 6.03
CECR2Q9BXF3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC52.64■■■■■ 6.02
CECR2Q9BXF3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC52.63■■■■■ 6.02
CECR2Q9BXF3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC52.63■■■■■ 6.01
CECR2Q9BXF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC52.63■■■■■ 6.01
CECR2Q9BXF3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC52.59■■■■■ 6.01
CECR2Q9BXF3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
CECR2Q9BXF3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.57■■■■■ 6.01
CECR2Q9BXF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC52.56■■■■■ 6
CECR2Q9BXF3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.55■■■■■ 6
CECR2Q9BXF3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC52.55■■■■■ 6
CECR2Q9BXF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.54■■■■■ 6
CECR2Q9BXF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC52.54■■■■■ 6
CECR2Q9BXF3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC52.52■■■■■ 6
CECR2Q9BXF3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.49■■■■■ 5.99
CECR2Q9BXF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC52.45■■■■■ 5.99
CECR2Q9BXF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC52.45■■■■■ 5.99
CECR2Q9BXF3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC52.41■■■■■ 5.98
CECR2Q9BXF3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.41■■■■■ 5.98
CECR2Q9BXF3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
CECR2Q9BXF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC52.35■■■■■ 5.97
CECR2Q9BXF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.35■■■■■ 5.97
CECR2Q9BXF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.35■■■■■ 5.97
CECR2Q9BXF3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC52.34■■■■■ 5.97
CECR2Q9BXF3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC52.33■■■■■ 5.97
CECR2Q9BXF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC52.31■■■■■ 5.96
CECR2Q9BXF3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC52.3■■■■■ 5.96
CECR2Q9BXF3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC52.28■■■■■ 5.96
CECR2Q9BXF3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC52.27■■■■■ 5.96
CECR2Q9BXF3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC52.27■■■■■ 5.96
CECR2Q9BXF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC52.25■■■■■ 5.96
CECR2Q9BXF3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC52.24■■■■■ 5.95
CECR2Q9BXF3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.22■■■■■ 5.95
CECR2Q9BXF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC52.2■■■■■ 5.95
CECR2Q9BXF3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC52.19■■■■■ 5.95
CECR2Q9BXF3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC52.18■■■■■ 5.94
CECR2Q9BXF3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.15■■■■■ 5.94
CECR2Q9BXF3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.14■■■■■ 5.94
CECR2Q9BXF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.14■■■■■ 5.94
CECR2Q9BXF3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.13■■■■■ 5.94
CECR2Q9BXF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC52.12■■■■■ 5.93
CECR2Q9BXF3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.1■■■■■ 5.93
CECR2Q9BXF3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.08■■■■■ 5.93
CECR2Q9BXF3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC52.08■■■■■ 5.93
CECR2Q9BXF3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
CECR2Q9BXF3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC52.04■■■■■ 5.92
CECR2Q9BXF3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.91
CECR2Q9BXF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC51.99■■■■■ 5.91
CECR2Q9BXF3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
CECR2Q9BXF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC51.99■■■■■ 5.91
CECR2Q9BXF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC51.99■■■■■ 5.91
CECR2Q9BXF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC51.99■■■■■ 5.91
CECR2Q9BXF3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
CECR2Q9BXF3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC51.95■■■■■ 5.91
CECR2Q9BXF3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC51.94■■■■■ 5.91
CECR2Q9BXF3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC51.93■■■■■ 5.9
CECR2Q9BXF3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.83■■■■■ 5.89
CECR2Q9BXF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.82■■■■■ 5.89
CECR2Q9BXF3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
CECR2Q9BXF3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC51.79■■■■■ 5.88
CECR2Q9BXF3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC51.77■■■■■ 5.88
CECR2Q9BXF3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.74■■■■■ 5.87
CECR2Q9BXF3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC51.73■■■■■ 5.87
CECR2Q9BXF3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.72■■■■■ 5.87
CECR2Q9BXF3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC51.71■■■■■ 5.87
CECR2Q9BXF3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC51.7■■■■■ 5.87
CECR2Q9BXF3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.65■■■■■ 5.86
CECR2Q9BXF3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
CECR2Q9BXF3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC51.63■■■■■ 5.86
CECR2Q9BXF3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
CECR2Q9BXF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
CECR2Q9BXF3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC51.61■■■■■ 5.85
CECR2Q9BXF3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC51.6■■■■■ 5.85
CECR2Q9BXF3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
CECR2Q9BXF3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC51.59■■■■■ 5.85
CECR2Q9BXF3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC51.58■■■■■ 5.85
CECR2Q9BXF3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.85
CECR2Q9BXF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
CECR2Q9BXF3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
CECR2Q9BXF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC51.56■■■■■ 5.84
CECR2Q9BXF3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC51.56■■■■■ 5.84
CECR2Q9BXF3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC51.51■■■■■ 5.84
CECR2Q9BXF3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC51.49■■■■■ 5.83
CECR2Q9BXF3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC51.47■■■■■ 5.83
CECR2Q9BXF3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC51.45■■■■■ 5.83
CECR2Q9BXF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
CECR2Q9BXF3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
CECR2Q9BXF3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC51.41■■■■■ 5.82
CECR2Q9BXF3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC51.39■■■■■ 5.82
CECR2Q9BXF3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
CECR2Q9BXF3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC51.37■■■■■ 5.81
CECR2Q9BXF3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
CECR2Q9BXF3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
CECR2Q9BXF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC51.32■■■■■ 5.81
CECR2Q9BXF3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC51.32■■■■■ 5.81
CECR2Q9BXF3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms