Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CDK19Q9BWU1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CDK19Q9BWU1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
CDK19Q9BWU1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CDK19Q9BWU1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CDK19Q9BWU1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
CDK19Q9BWU1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CDK19Q9BWU1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
CDK19Q9BWU1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CDK19Q9BWU1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CDK19Q9BWU1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CDK19Q9BWU1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CDK19Q9BWU1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CDK19Q9BWU1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CDK19Q9BWU1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CDK19Q9BWU1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CDK19Q9BWU1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CDK19Q9BWU1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CDK19Q9BWU1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CDK19Q9BWU1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CDK19Q9BWU1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CDK19Q9BWU1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
CDK19Q9BWU1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CDK19Q9BWU1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CDK19Q9BWU1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CDK19Q9BWU1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
CDK19Q9BWU1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CDK19Q9BWU1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
CDK19Q9BWU1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CDK19Q9BWU1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CDK19Q9BWU1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK19Q9BWU1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK19Q9BWU1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CDK19Q9BWU1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CDK19Q9BWU1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CDK19Q9BWU1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CDK19Q9BWU1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CDK19Q9BWU1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CDK19Q9BWU1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CDK19Q9BWU1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CDK19Q9BWU1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CDK19Q9BWU1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CDK19Q9BWU1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CDK19Q9BWU1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CDK19Q9BWU1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CDK19Q9BWU1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CDK19Q9BWU1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CDK19Q9BWU1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CDK19Q9BWU1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CDK19Q9BWU1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CDK19Q9BWU1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CDK19Q9BWU1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CDK19Q9BWU1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CDK19Q9BWU1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
CDK19Q9BWU1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CDK19Q9BWU1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
CDK19Q9BWU1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CDK19Q9BWU1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CDK19Q9BWU1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CDK19Q9BWU1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CDK19Q9BWU1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CDK19Q9BWU1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
CDK19Q9BWU1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CDK19Q9BWU1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CDK19Q9BWU1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CDK19Q9BWU1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CDK19Q9BWU1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CDK19Q9BWU1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CDK19Q9BWU1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CDK19Q9BWU1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CDK19Q9BWU1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
CDK19Q9BWU1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CDK19Q9BWU1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK19Q9BWU1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK19Q9BWU1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CDK19Q9BWU1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CDK19Q9BWU1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CDK19Q9BWU1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CDK19Q9BWU1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CDK19Q9BWU1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CDK19Q9BWU1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
CDK19Q9BWU1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CDK19Q9BWU1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CDK19Q9BWU1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CDK19Q9BWU1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CDK19Q9BWU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CDK19Q9BWU1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CDK19Q9BWU1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CDK19Q9BWU1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CDK19Q9BWU1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms