Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED18Q9BUE0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED18Q9BUE0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED18Q9BUE0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED18Q9BUE0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED18Q9BUE0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED18Q9BUE0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MED18Q9BUE0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MED18Q9BUE0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED18Q9BUE0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED18Q9BUE0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED18Q9BUE0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED18Q9BUE0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED18Q9BUE0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED18Q9BUE0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED18Q9BUE0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED18Q9BUE0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED18Q9BUE0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED18Q9BUE0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED18Q9BUE0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED18Q9BUE0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED18Q9BUE0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED18Q9BUE0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED18Q9BUE0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MED18Q9BUE0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED18Q9BUE0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED18Q9BUE0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED18Q9BUE0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED18Q9BUE0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED18Q9BUE0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED18Q9BUE0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED18Q9BUE0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MED18Q9BUE0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED18Q9BUE0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED18Q9BUE0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MED18Q9BUE0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED18Q9BUE0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED18Q9BUE0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MED18Q9BUE0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED18Q9BUE0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED18Q9BUE0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED18Q9BUE0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MED18Q9BUE0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MED18Q9BUE0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MED18Q9BUE0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED18Q9BUE0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms