Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYT17Q9BSW7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SYT17Q9BSW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYT17Q9BSW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYT17Q9BSW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYT17Q9BSW7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYT17Q9BSW7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SYT17Q9BSW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYT17Q9BSW7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYT17Q9BSW7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYT17Q9BSW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SYT17Q9BSW7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYT17Q9BSW7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SYT17Q9BSW7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SYT17Q9BSW7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
SYT17Q9BSW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SYT17Q9BSW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SYT17Q9BSW7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SYT17Q9BSW7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
SYT17Q9BSW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
SYT17Q9BSW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SYT17Q9BSW7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SYT17Q9BSW7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SYT17Q9BSW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SYT17Q9BSW7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SYT17Q9BSW7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SYT17Q9BSW7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SYT17Q9BSW7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SYT17Q9BSW7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYT17Q9BSW7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYT17Q9BSW7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYT17Q9BSW7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYT17Q9BSW7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SYT17Q9BSW7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SYT17Q9BSW7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SYT17Q9BSW7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYT17Q9BSW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SYT17Q9BSW7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
SYT17Q9BSW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYT17Q9BSW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SYT17Q9BSW7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SYT17Q9BSW7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SYT17Q9BSW7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SYT17Q9BSW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SYT17Q9BSW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SYT17Q9BSW7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYT17Q9BSW7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SYT17Q9BSW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SYT17Q9BSW7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SYT17Q9BSW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYT17Q9BSW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SYT17Q9BSW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SYT17Q9BSW7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SYT17Q9BSW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYT17Q9BSW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SYT17Q9BSW7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SYT17Q9BSW7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SYT17Q9BSW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SYT17Q9BSW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SYT17Q9BSW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYT17Q9BSW7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SYT17Q9BSW7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SYT17Q9BSW7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
SYT17Q9BSW7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYT17Q9BSW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYT17Q9BSW7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYT17Q9BSW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYT17Q9BSW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYT17Q9BSW7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYT17Q9BSW7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYT17Q9BSW7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYT17Q9BSW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYT17Q9BSW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYT17Q9BSW7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYT17Q9BSW7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYT17Q9BSW7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYT17Q9BSW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYT17Q9BSW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYT17Q9BSW7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYT17Q9BSW7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYT17Q9BSW7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYT17Q9BSW7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYT17Q9BSW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYT17Q9BSW7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYT17Q9BSW7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYT17Q9BSW7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYT17Q9BSW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYT17Q9BSW7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SYT17Q9BSW7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYT17Q9BSW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SYT17Q9BSW7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SYT17Q9BSW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYT17Q9BSW7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SYT17Q9BSW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SYT17Q9BSW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
SYT17Q9BSW7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYT17Q9BSW7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYT17Q9BSW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SYT17Q9BSW7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SYT17Q9BSW7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms