Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF559Q9BR84 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF559Q9BR84 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF559Q9BR84 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF559Q9BR84 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF559Q9BR84 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF559Q9BR84 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF559Q9BR84 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF559Q9BR84 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF559Q9BR84 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF559Q9BR84 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF559Q9BR84 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF559Q9BR84 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF559Q9BR84 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF559Q9BR84 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF559Q9BR84 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF559Q9BR84 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF559Q9BR84 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF559Q9BR84 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF559Q9BR84 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF559Q9BR84 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF559Q9BR84 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF559Q9BR84 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF559Q9BR84 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF559Q9BR84 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF559Q9BR84 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF559Q9BR84 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF559Q9BR84 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF559Q9BR84 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF559Q9BR84 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF559Q9BR84 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF559Q9BR84 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF559Q9BR84 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF559Q9BR84 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF559Q9BR84 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF559Q9BR84 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF559Q9BR84 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF559Q9BR84 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF559Q9BR84 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms