Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI9

NRIP2, Nuclear receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP2Q9BQI9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NRIP2Q9BQI9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP2Q9BQI9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP2Q9BQI9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP2Q9BQI9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP2Q9BQI9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRIP2Q9BQI9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP2Q9BQI9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP2Q9BQI9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP2Q9BQI9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP2Q9BQI9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP2Q9BQI9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP2Q9BQI9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP2Q9BQI9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP2Q9BQI9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP2Q9BQI9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP2Q9BQI9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP2Q9BQI9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP2Q9BQI9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP2Q9BQI9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP2Q9BQI9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP2Q9BQI9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP2Q9BQI9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NRIP2Q9BQI9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NRIP2Q9BQI9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRIP2Q9BQI9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 483 ms